91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1774 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  7e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  42.11 
 
 		 621 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  37.61 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0942  hypothetical protein  36.36 
 
 		 351 aa  75.5  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  35.51 
 
 		 691 aa  74.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  34.42 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  31.62 
 
 		 519 aa  69.3  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  34.4 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  33.65 
 
 		 772 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  29.13 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  32.43 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  32.46 
 
 		 768 aa  62.4  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  29.45 
 
 		 530 aa  61.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  35.05 
 
 		 769 aa  60.8  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  32.77 
 
 		 361 aa  60.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  29.7 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  35.14 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  28.18 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  26.73 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  26.73 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  33.65 
 
 		 770 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1361  MORN variant repeat protein  32.65 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616992  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  30.77 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  27.19 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  31.73 
 
 		 770 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  30.89 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  29.1 
 
 		 769 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  31.07 
 
 		 770 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  31.07 
 
 		 770 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  29.1 
 
 		 769 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  27.36 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  30.19 
 
 		 770 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  29.7 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  31.07 
 
 		 770 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4388  hypothetical protein  26.53 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748198  normal  0.178906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  27.35 
 
 		 746 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  26.76 
 
 		 838 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  26.76 
 
 		 838 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  27.34 
 
 		 759 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  27.97 
 
 		 755 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  26.36 
 
 		 300 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1250  hypothetical protein  36.49 
 
 		 115 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220224  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  30.43 
 
 		 534 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  27.97 
 
 		 755 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  20 
 
 		 590 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 351 aa  51.2  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  26.06 
 
 		 838 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  30.25 
 
 		 720 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  29.9 
 
 		 757 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  25.35 
 
 		 836 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  24.77 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  24.77 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0968  hypothetical protein  35.8 
 
 		 545 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  26.09 
 
 		 571 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  30.48 
 
 		 354 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  30.25 
 
 		 720 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  29.41 
 
 		 720 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0761  hypothetical protein  29.75 
 
 		 823 aa  47.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.132602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  25.51 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  28.16 
 
 		 238 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  28.95 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  24.74 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  28.57 
 
 		 332 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  20.36 
 
 		 440 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  27.2 
 
 		 350 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3190  hypothetical protein  24.65 
 
 		 272 aa  44.7  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00644171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5689  hypothetical protein  28.3 
 
 		 357 aa  44.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  25.23 
 
 		 722 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  29.91 
 
 		 566 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0473  hypothetical protein  32.05 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  26.09 
 
 		 580 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  31.11 
 
 		 580 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01955  hypothetical protein  35.29 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2294  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0453403  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  27.2 
 
 		 350 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  25.96 
 
 		 614 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0281  hypothetical protein  32.89 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  28.97 
 
 		 566 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0610  hypothetical protein  31.34 
 
 		 262 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  28.97 
 
 		 566 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  27.91 
 
 		 566 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  27.91 
 
 		 818 aa  41.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  28.05 
 
 		 602 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2296  hypothetical protein  30.49 
 
 		 106 aa  41.2  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000811573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6615  MORN repeat-containing protein  26.32 
 
 		 356 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  45.95 
 
 		 577 aa  40.8  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  28.32 
 
 		 566 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0598  hypothetical protein  25.2 
 
 		 342 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  28.97 
 
 		 566 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  30.77 
 
 		 454 aa  40.8  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>