89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  358  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  98.31 
 
 
178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  66.29 
 
 
181 aa  226  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  61.93 
 
 
180 aa  222  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  33.33 
 
 
770 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  31.88 
 
 
770 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  31.16 
 
 
770 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  31.16 
 
 
770 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  34.95 
 
 
768 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  30.72 
 
 
770 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  31.16 
 
 
770 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  29.61 
 
 
772 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  35.95 
 
 
566 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  28.35 
 
 
291 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  31.09 
 
 
354 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  27.27 
 
 
722 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  39.36 
 
 
566 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  30.07 
 
 
769 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  26.74 
 
 
722 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  26.74 
 
 
722 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  30.07 
 
 
769 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  29.45 
 
 
240 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  26.74 
 
 
722 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  39.36 
 
 
566 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  26.11 
 
 
519 aa  61.6  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  39.36 
 
 
566 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  27.83 
 
 
530 aa  61.6  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  29.37 
 
 
691 aa  61.6  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  34.69 
 
 
838 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  34.69 
 
 
836 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  29.05 
 
 
769 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  33.67 
 
 
838 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  31.45 
 
 
327 aa  60.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  33.67 
 
 
838 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  34.56 
 
 
449 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  29.9 
 
 
534 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  32.84 
 
 
755 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  29.17 
 
 
239 aa  57.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  32.84 
 
 
755 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  29.41 
 
 
230 aa  57  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  35.23 
 
 
566 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  32.84 
 
 
238 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  28.17 
 
 
332 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  32.59 
 
 
424 aa  55.8  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  33.68 
 
 
757 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  34.09 
 
 
566 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  34.09 
 
 
566 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  37.11 
 
 
566 aa  54.7  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  33.68 
 
 
759 aa  54.7  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  30.28 
 
 
580 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  39.76 
 
 
577 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  38.55 
 
 
577 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  25 
 
 
203 aa  51.6  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  32.33 
 
 
602 aa  51.6  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  36.96 
 
 
576 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  24.77 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0116  hypothetical protein  33.05 
 
 
351 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  24.82 
 
 
226 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  39.33 
 
 
571 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  37.08 
 
 
577 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  38.04 
 
 
576 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  39.33 
 
 
576 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  27.27 
 
 
300 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  22.84 
 
 
361 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  25.47 
 
 
454 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  38.64 
 
 
577 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  22.9 
 
 
720 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  23.26 
 
 
720 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  23.26 
 
 
720 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  25.42 
 
 
197 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  25.45 
 
 
746 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  33.33 
 
 
621 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0761  hypothetical protein  33.33 
 
 
823 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.132602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
351 aa  45.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  26.97 
 
 
580 aa  45.1  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2566  MORN variant repeat protein  29.91 
 
 
471 aa  44.7  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000064854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1044  hypothetical protein  29.17 
 
 
352 aa  45.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2570  MORN variant repeat protein  29.91 
 
 
472 aa  44.7  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000227673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.57 
 
 
590 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0593  MORN repeat-containing protein  27.69 
 
 
158 aa  44.3  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  29.66 
 
 
440 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  23.29 
 
 
274 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  23.73 
 
 
159 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1644  FliI/YscN family ATPase  27.93 
 
 
442 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0546828  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  24.18 
 
 
134 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2734  putative lipoprotein  26.28 
 
 
278 aa  41.6  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000371316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  24.14 
 
 
173 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  28.87 
 
 
488 aa  41.2  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>