78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  67.42 
 
 
178 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  66.29 
 
 
178 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  62.64 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  32.91 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  34.84 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  32.12 
 
 
354 aa  64.3  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  34.29 
 
 
566 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  34.29 
 
 
566 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  33.93 
 
 
772 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  34.29 
 
 
566 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  31.16 
 
 
566 aa  62  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  28.14 
 
 
291 aa  61.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  26.32 
 
 
361 aa  61.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  34.78 
 
 
566 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  34.78 
 
 
566 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  33.64 
 
 
566 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  28.57 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  33.64 
 
 
768 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  30.51 
 
 
566 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  33.33 
 
 
580 aa  57.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  28.66 
 
 
770 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  25.45 
 
 
203 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  26.35 
 
 
519 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  27.21 
 
 
332 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  27.73 
 
 
530 aa  57  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  25.9 
 
 
691 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  28.66 
 
 
770 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  24.09 
 
 
226 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  31.58 
 
 
770 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  32.58 
 
 
238 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  29.03 
 
 
770 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  29.03 
 
 
770 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  25 
 
 
534 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  26.81 
 
 
722 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  26.81 
 
 
722 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  30.37 
 
 
770 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  35.63 
 
 
424 aa  51.6  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1361  MORN variant repeat protein  23.08 
 
 
221 aa  51.6  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  32.67 
 
 
769 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  27.66 
 
 
300 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  26.09 
 
 
722 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  26.09 
 
 
722 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  26.85 
 
 
816 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  31.58 
 
 
769 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  31.58 
 
 
769 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  28.23 
 
 
327 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  25.58 
 
 
454 aa  48.5  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  27.52 
 
 
816 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  26.11 
 
 
347 aa  48.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1108  hypothetical protein  31.46 
 
 
176 aa  47.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000270207  hitchhiker  0.00000000131688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  33.72 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  28.97 
 
 
838 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  28.97 
 
 
838 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  24.49 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  26.06 
 
 
755 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4388  hypothetical protein  30.1 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748198  normal  0.178906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  31.4 
 
 
175 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  26.95 
 
 
755 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  25 
 
 
274 aa  44.7  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0761  hypothetical protein  32.26 
 
 
823 aa  44.3  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.132602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  29.91 
 
 
759 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  31.4 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  22.95 
 
 
816 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  27.45 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  28.04 
 
 
836 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  28.04 
 
 
838 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2566  MORN variant repeat protein  28.8 
 
 
471 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000064854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0104  hypothetical protein  25.56 
 
 
390 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.432499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  22.76 
 
 
746 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  24.49 
 
 
134 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  26.98 
 
 
818 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2570  MORN variant repeat protein  28.57 
 
 
472 aa  41.6  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000227673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  20.51 
 
 
720 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  20.51 
 
 
720 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  28.91 
 
 
829 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  28 
 
 
602 aa  41.2  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  26.5 
 
 
187 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>