29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0116 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0116  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  727    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  44.82 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1044  hypothetical protein  44.96 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  26.74 
 
 		 530 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  26.53 
 
 		 770 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.53 
 
 		 770 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  26.53 
 
 		 770 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  33.05 
 
 		 178 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  25.77 
 
 		 770 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  24.56 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  26.36 
 
 		 203 aa  50.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  33.05 
 
 		 178 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  24.73 
 
 		 621 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  25.3 
 
 		 519 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  26.34 
 
 		 534 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  25.1 
 
 		 759 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  27.17 
 
 		 566 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  26.22 
 
 		 691 aa  46.2  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  23.92 
 
 		 768 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  39.76 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  30.86 
 
 		 770 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  23.14 
 
 		 746 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  39.76 
 
 		 566 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  22.3 
 
 		 769 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  22.3 
 
 		 769 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  23.05 
 
 		 770 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  38.55 
 
 		 566 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  24.07 
 
 		 720 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  25.54 
 
 		 755 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>