88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1068 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  36.7 
 
 		 838 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  34.86 
 
 		 755 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  35.34 
 
 		 836 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  33.94 
 
 		 757 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  33.94 
 
 		 755 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  34.86 
 
 		 838 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  32.11 
 
 		 759 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  33.94 
 
 		 838 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  30.72 
 
 		 770 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  31.69 
 
 		 770 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  33.11 
 
 		 720 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  30.34 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  31.4 
 
 		 772 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  31.65 
 
 		 769 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  32.45 
 
 		 720 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  33.61 
 
 		 770 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  33.61 
 
 		 770 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  33.61 
 
 		 770 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  31.65 
 
 		 769 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  32.45 
 
 		 720 aa  68.2  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  32.77 
 
 		 770 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  32.58 
 
 		 691 aa  65.5  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  31.67 
 
 		 769 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  27.27 
 
 		 722 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  27.27 
 
 		 722 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  31.06 
 
 		 746 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  27.27 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  27.27 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  29.13 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  36.89 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  26.5 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  28.24 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  25.89 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  26.83 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  32.23 
 
 		 361 aa  58.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  25.45 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  24.67 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5145  MORN variant repeat protein  26.45 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.266583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  30.89 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  27.56 
 
 		 768 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  29.17 
 
 		 534 aa  55.1  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5435  MORN repeat-containing protein  29.35 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.416219  normal  0.0770205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  26.19 
 
 		 327 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  24.44 
 
 		 580 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  26.12 
 
 		 519 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3699  hypothetical protein  29.07 
 
 		 568 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000308051 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  25.89 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  27.34 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  28.04 
 
 		 354 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0116  hypothetical protein  26.36 
 
 		 351 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  25.42 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  25.17 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  24.79 
 
 		 566 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  24.22 
 
 		 566 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  24.22 
 
 		 566 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1044  hypothetical protein  25.56 
 
 		 352 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  29.23 
 
 		 300 aa  48.9  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0593  MORN repeat-containing protein  31.63 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  25.62 
 
 		 566 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  24.22 
 
 		 566 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  27.78 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  24.03 
 
 		 566 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  27.12 
 
 		 621 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  24.68 
 
 		 566 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  22.36 
 
 		 159 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  22.88 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  24.63 
 
 		 576 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  24.63 
 
 		 576 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  24.63 
 
 		 576 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  26.61 
 
 		 332 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  23.44 
 
 		 566 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  24.29 
 
 		 577 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  26.45 
 
 		 577 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  24.29 
 
 		 577 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  23.88 
 
 		 577 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5579  hypothetical protein  37.25 
 
 		 275 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2397  hypothetical protein  27.5 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  20.79 
 
 		 590 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  24.04 
 
 		 440 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  32.91 
 
 		 580 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  21.26 
 
 		 347 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0598  hypothetical protein  21.33 
 
 		 342 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2239  hypothetical protein  24.39 
 
 		 154 aa  41.2  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0281  hypothetical protein  29.06 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>