73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0831 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  63.57 
 
 
838 aa  858    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  93.39 
 
 
757 aa  1470    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  62.84 
 
 
836 aa  846    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  100 
 
 
755 aa  1578    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  96.29 
 
 
755 aa  1528    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  62.8 
 
 
838 aa  850    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  58.09 
 
 
746 aa  884    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  73.95 
 
 
759 aa  1164    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  62.65 
 
 
838 aa  851    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  24.87 
 
 
691 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  22.85 
 
 
530 aa  92  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  30 
 
 
291 aa  91.3  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  26.63 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  26.07 
 
 
769 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  26.27 
 
 
769 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  33.94 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  29.07 
 
 
722 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  25.35 
 
 
722 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  25.35 
 
 
722 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  25.35 
 
 
722 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  25 
 
 
770 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  28.46 
 
 
621 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  25.16 
 
 
770 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  25.57 
 
 
770 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  25.91 
 
 
770 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  25.41 
 
 
770 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  24.67 
 
 
720 aa  67.4  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  24.73 
 
 
770 aa  67.4  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  24.67 
 
 
720 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  26.89 
 
 
449 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  22.12 
 
 
454 aa  67  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  29.59 
 
 
768 aa  66.6  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  24.67 
 
 
720 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  24.58 
 
 
300 aa  63.9  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  28.65 
 
 
772 aa  63.9  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  30.41 
 
 
566 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  24.03 
 
 
361 aa  59.7  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  29.82 
 
 
566 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  32.38 
 
 
580 aa  58.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  29.82 
 
 
566 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  32.84 
 
 
178 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  28.57 
 
 
424 aa  57.8  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  32.84 
 
 
178 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  33.02 
 
 
566 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  33.02 
 
 
566 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  24.54 
 
 
769 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  23.72 
 
 
519 aa  55.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  31.43 
 
 
566 aa  55.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  32.08 
 
 
566 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  35.24 
 
 
440 aa  54.7  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  24.05 
 
 
327 aa  54.3  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  24.26 
 
 
226 aa  53.5  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  27.97 
 
 
171 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  24.64 
 
 
580 aa  52.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  24.2 
 
 
332 aa  52.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  21.37 
 
 
571 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  30.77 
 
 
188 aa  51.2  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  26.48 
 
 
240 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  30.32 
 
 
203 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0761  hypothetical protein  27.54 
 
 
823 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.132602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1361  MORN variant repeat protein  28.44 
 
 
221 aa  47.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  26.17 
 
 
187 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.4 
 
 
590 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  23.24 
 
 
577 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  27.01 
 
 
181 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4778  hypothetical protein  32.14 
 
 
404 aa  45.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  24 
 
 
197 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  24.44 
 
 
566 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  18.36 
 
 
577 aa  45.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  27.37 
 
 
180 aa  44.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  20.21 
 
 
576 aa  44.3  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  31.61 
 
 
347 aa  44.3  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  21.24 
 
 
602 aa  44.3  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>