76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3416 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  63.07 
 
 		 178 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  61.93 
 
 		 178 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  62.64 
 
 		 181 aa  210  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  26.76 
 
 		 530 aa  71.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  32.52 
 
 		 240 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  30.67 
 
 		 768 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  37.23 
 
 		 424 aa  65.1  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  31.79 
 
 		 769 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  26.43 
 
 		 691 aa  64.3  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  28.8 
 
 		 519 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  29.45 
 
 		 449 aa  62  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  31.76 
 
 		 770 aa  61.6  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  30.41 
 
 		 769 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  28.46 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  30.41 
 
 		 769 aa  60.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  29.73 
 
 		 770 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  25.89 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  27.61 
 
 		 722 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  27.61 
 
 		 722 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  26.54 
 
 		 722 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  31.25 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  24.69 
 
 		 722 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  30.08 
 
 		 354 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  28.45 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  23.49 
 
 		 720 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  23.49 
 
 		 720 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  23.49 
 
 		 720 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  25.15 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  27.88 
 
 		 838 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  27.88 
 
 		 838 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  28.43 
 
 		 534 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  26.62 
 
 		 566 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  30.08 
 
 		 566 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  32 
 
 		 566 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  21.43 
 
 		 226 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  32 
 
 		 566 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  25.55 
 
 		 836 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  27.78 
 
 		 580 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  27.42 
 
 		 770 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  24.11 
 
 		 454 aa  51.6  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  31.15 
 
 		 772 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  28.46 
 
 		 566 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  27.42 
 
 		 770 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  32 
 
 		 566 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  23.33 
 
 		 361 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  28.46 
 
 		 566 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  28.46 
 
 		 566 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  24 
 
 		 332 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  30.08 
 
 		 746 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0593  MORN repeat-containing protein  30 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  27.18 
 
 		 838 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  27.88 
 
 		 759 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  27.14 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  27.14 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  26.62 
 
 		 621 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  28.46 
 
 		 327 aa  48.5  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  27.43 
 
 		 602 aa  48.5  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  25.81 
 
 		 770 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  25.51 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  25.81 
 
 		 770 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  27.14 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  21.62 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0104  hypothetical protein  26.62 
 
 		 390 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.432499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  27.06 
 
 		 755 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  27.37 
 
 		 755 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1108  hypothetical protein  32.43 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000270207  hitchhiker  0.00000000131688 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2734  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 278 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000371316  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  26.76 
 
 		 347 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  20.39 
 
 		 274 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  25.89 
 
 		 230 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0761  hypothetical protein  33.33 
 
 		 823 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.132602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  25.88 
 
 		 757 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1361  MORN variant repeat protein  22.94 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616992  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  28.08 
 
 		 500 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>