34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1361 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1361  MORN variant repeat protein  100 
 
 
221 aa  437  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  30.93 
 
 
449 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  32.65 
 
 
171 aa  58.9  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  31.58 
 
 
354 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  28.42 
 
 
134 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  23.08 
 
 
181 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  33.01 
 
 
534 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  28.23 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  29.13 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  29.66 
 
 
332 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  28.44 
 
 
755 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  31.11 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  33.63 
 
 
454 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  28.8 
 
 
361 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  28 
 
 
769 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  28.11 
 
 
327 aa  45.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  32.35 
 
 
720 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  26.61 
 
 
755 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2397  hypothetical protein  36.67 
 
 
320 aa  45.1  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  31 
 
 
770 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  31 
 
 
770 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  31 
 
 
770 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  31 
 
 
770 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4111  YD repeat-containing protein  30.63 
 
 
1687 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  27.93 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  31.37 
 
 
720 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4284  YD repeat-containing protein  30.63 
 
 
1687 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  26.14 
 
 
274 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  25.77 
 
 
175 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  31.03 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  30.39 
 
 
720 aa  42.4  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  28.38 
 
 
757 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  30.69 
 
 
621 aa  42  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  24.79 
 
 
571 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>