95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0395 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  894    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  31.6 
 
 
291 aa  120  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  28.42 
 
 
691 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  26.01 
 
 
530 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  27.7 
 
 
768 aa  96.3  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  27.46 
 
 
534 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  28.4 
 
 
770 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  25.58 
 
 
519 aa  94  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  27.63 
 
 
722 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  27.63 
 
 
722 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  27.63 
 
 
722 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  26.84 
 
 
769 aa  90.1  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  26.57 
 
 
769 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  27.33 
 
 
722 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  25.21 
 
 
770 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  31.5 
 
 
621 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  24.58 
 
 
770 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  25.73 
 
 
769 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  24 
 
 
772 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.14 
 
 
770 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  21.37 
 
 
759 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  25.29 
 
 
770 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  25.94 
 
 
720 aa  83.6  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  24.29 
 
 
770 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  32.33 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  25.94 
 
 
720 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  37.88 
 
 
188 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  25.94 
 
 
720 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  21.2 
 
 
757 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  22.46 
 
 
755 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  22.19 
 
 
746 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  20.88 
 
 
836 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  32.46 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  23.46 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  21.31 
 
 
755 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  21.34 
 
 
838 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  26.83 
 
 
361 aa  77  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  20.57 
 
 
838 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  20.83 
 
 
838 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  29.03 
 
 
226 aa  72.4  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  19.29 
 
 
449 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  30 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  26.16 
 
 
566 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  22.98 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  26.36 
 
 
566 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  26.51 
 
 
566 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  23.35 
 
 
440 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  26.51 
 
 
580 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  28.05 
 
 
566 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  26.41 
 
 
566 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  27.16 
 
 
566 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  26.72 
 
 
566 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  24.59 
 
 
566 aa  57.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  24.67 
 
 
203 aa  57.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  28.64 
 
 
300 aa  57  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  23.45 
 
 
602 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  22.64 
 
 
424 aa  55.8  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  28.64 
 
 
577 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  30.46 
 
 
577 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  24.81 
 
 
818 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  30.46 
 
 
577 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  25.18 
 
 
571 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  27.69 
 
 
828 aa  53.5  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  25.41 
 
 
829 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  21.5 
 
 
614 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  27.68 
 
 
197 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  28.43 
 
 
576 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  28.43 
 
 
576 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  28.43 
 
 
576 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  30.77 
 
 
580 aa  52.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  27.64 
 
 
239 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  24.11 
 
 
180 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  22.83 
 
 
238 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  24.36 
 
 
829 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  27.17 
 
 
484 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  25.47 
 
 
577 aa  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  25.21 
 
 
829 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  25.47 
 
 
178 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  21.67 
 
 
576 aa  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  25.47 
 
 
178 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  29.13 
 
 
230 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0593  MORN repeat-containing protein  32.65 
 
 
158 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1361  MORN variant repeat protein  33.63 
 
 
221 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616992  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  25.47 
 
 
181 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4778  hypothetical protein  18.96 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2566  MORN variant repeat protein  28.51 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000064854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  29.55 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2570  MORN variant repeat protein  28.07 
 
 
472 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000227673  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  25.93 
 
 
159 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  23.48 
 
 
816 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  23.75 
 
 
816 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5145  MORN variant repeat protein  25.51 
 
 
199 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.266583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  29.87 
 
 
203 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.6 
 
 
590 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>