43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3410 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  100 
 
 		 614 aa  1263    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  48.06 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  27.74 
 
 		 769 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  29.53 
 
 		 621 aa  67.8  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  25.13 
 
 		 770 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  27.98 
 
 		 770 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  28.29 
 
 		 768 aa  60.8  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  28.83 
 
 		 770 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  28.83 
 
 		 770 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  28.83 
 
 		 770 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  27.98 
 
 		 691 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  28.16 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  27.1 
 
 		 769 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  27.33 
 
 		 534 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  25.36 
 
 		 769 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  29.91 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  27.1 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1087  hypothetical protein  24.06 
 
 		 147 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000445944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  25.84 
 
 		 770 aa  53.9  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  25.52 
 
 		 566 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  25.83 
 
 		 580 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  26.34 
 
 		 566 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  27.33 
 
 		 332 aa  52.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  24.62 
 
 		 566 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  36.59 
 
 		 327 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  21.5 
 
 		 454 aa  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  22.84 
 
 		 197 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  25.81 
 
 		 566 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  25 
 
 		 188 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  25.17 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  23.23 
 
 		 530 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  24.69 
 
 		 519 aa  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  30.43 
 
 		 580 aa  47.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  27.5 
 
 		 159 aa  47.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  31.52 
 
 		 577 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  31.52 
 
 		 577 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  28.44 
 
 		 300 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  31.52 
 
 		 577 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  25.49 
 
 		 274 aa  45.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  27.27 
 
 		 347 aa  45.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2239  hypothetical protein  24.82 
 
 		 154 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  21 
 
 		 566 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  24.68 
 
 		 226 aa  44.3  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>