43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2239 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2239  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  320  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3367  hypothetical protein  40.44 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379877  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  31.93 
 
 		 534 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  26.28 
 
 		 440 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  33.64 
 
 		 769 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  34.31 
 
 		 621 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  30.69 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  28.3 
 
 		 530 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  28.26 
 
 		 722 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  28.43 
 
 		 720 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  26.39 
 
 		 566 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  28.43 
 
 		 720 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  28.43 
 
 		 720 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  28.26 
 
 		 722 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  28.26 
 
 		 722 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  28.26 
 
 		 722 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  26.39 
 
 		 566 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  24.82 
 
 		 614 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  25.69 
 
 		 566 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  24.39 
 
 		 691 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  27.78 
 
 		 768 aa  43.9  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4778  hypothetical protein  28.83 
 
 		 404 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  34.71 
 
 		 769 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  24.56 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  34.71 
 
 		 770 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0451  hypothetical protein  37.18 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.123907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  29.41 
 
 		 838 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  29.41 
 
 		 838 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3344  hypothetical protein  32.22 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000000293232  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  25.95 
 
 		 757 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  25.95 
 
 		 755 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  29.85 
 
 		 602 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  24.39 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  30 
 
 		 746 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  29.41 
 
 		 836 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  29.41 
 
 		 838 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  27.1 
 
 		 580 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  27.45 
 
 		 566 aa  41.2  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  27.19 
 
 		 566 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 351 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  24.76 
 
 		 274 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.27 
 
 		 770 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  26.27 
 
 		 770 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>