68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0803 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  61.21 
 
 
838 aa  833    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  61.85 
 
 
836 aa  838    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  73.49 
 
 
759 aa  1154    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  100 
 
 
757 aa  1580    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  57.42 
 
 
746 aa  876    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  61.42 
 
 
838 aa  837    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  93.39 
 
 
755 aa  1477    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  93.13 
 
 
755 aa  1469    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  61.67 
 
 
838 aa  840    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  21.53 
 
 
530 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  26.32 
 
 
691 aa  92  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  29.66 
 
 
291 aa  89.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  26.18 
 
 
534 aa  83.2  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  24.57 
 
 
769 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  26.41 
 
 
722 aa  78.2  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  26.41 
 
 
722 aa  78.2  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  33.94 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  26.41 
 
 
722 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  26.05 
 
 
769 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  26.41 
 
 
722 aa  77.4  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  25.39 
 
 
770 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  26.91 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  25.9 
 
 
621 aa  71.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  23.2 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  24.6 
 
 
770 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  24.59 
 
 
720 aa  67.4  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  24.59 
 
 
720 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  23.92 
 
 
770 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  24.59 
 
 
720 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  25.42 
 
 
300 aa  66.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  23.99 
 
 
770 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  32.09 
 
 
770 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  23.63 
 
 
770 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  29.56 
 
 
424 aa  63.2  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  26.45 
 
 
361 aa  62  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  31.65 
 
 
188 aa  60.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  23.21 
 
 
768 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  33.96 
 
 
566 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  32.38 
 
 
580 aa  58.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  22.34 
 
 
769 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  33.96 
 
 
566 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  23.39 
 
 
772 aa  58.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  30.23 
 
 
566 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  33.02 
 
 
566 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  22.85 
 
 
519 aa  56.2  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  29.65 
 
 
566 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  31.43 
 
 
566 aa  55.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  33.68 
 
 
178 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  33.68 
 
 
178 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  24.84 
 
 
332 aa  54.3  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  31.93 
 
 
566 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  35.24 
 
 
440 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  25.56 
 
 
602 aa  51.2  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  23.3 
 
 
226 aa  50.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  29.9 
 
 
171 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.56 
 
 
590 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  25.97 
 
 
327 aa  48.5  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  24.32 
 
 
577 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  26.17 
 
 
187 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  28.49 
 
 
566 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  24 
 
 
197 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  26.03 
 
 
240 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  22.44 
 
 
571 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  20.13 
 
 
580 aa  45.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  25.15 
 
 
577 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  23.24 
 
 
577 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  32.26 
 
 
347 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5145  MORN variant repeat protein  25.4 
 
 
199 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.266583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>