36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5145 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5145  MORN variant repeat protein  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.266583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  28.41 
 
 
187 aa  89  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  26.45 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  33.04 
 
 
691 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  30.94 
 
 
768 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  39.13 
 
 
838 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  32.11 
 
 
720 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  32.11 
 
 
720 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  38.81 
 
 
836 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  31.19 
 
 
720 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  29.63 
 
 
772 aa  48.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  33.33 
 
 
530 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  27.64 
 
 
566 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  26.56 
 
 
580 aa  44.7  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  25.4 
 
 
757 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  30.43 
 
 
769 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  30.1 
 
 
300 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  28.75 
 
 
838 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  27.59 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  32.14 
 
 
722 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  32.14 
 
 
722 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  29.76 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  26.83 
 
 
566 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  25.51 
 
 
454 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  34.18 
 
 
769 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  32.14 
 
 
722 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  32.14 
 
 
722 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  28.75 
 
 
838 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  25 
 
 
770 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  29.35 
 
 
770 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  25 
 
 
770 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  27.1 
 
 
534 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  24.6 
 
 
755 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  31.65 
 
 
770 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  34.29 
 
 
769 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  26.19 
 
 
746 aa  41.2  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>