85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2965 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  71.48 
 
 
566 aa  812    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  71.48 
 
 
566 aa  817    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  79.08 
 
 
580 aa  902    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  78.07 
 
 
566 aa  889    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  69.7 
 
 
566 aa  793    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  71.66 
 
 
566 aa  810    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  100 
 
 
566 aa  1159    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  94.35 
 
 
566 aa  1071    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  95.94 
 
 
566 aa  1092    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  28.18 
 
 
571 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  27.37 
 
 
602 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  25.49 
 
 
576 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  25.7 
 
 
577 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  24.78 
 
 
580 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  25.39 
 
 
577 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  24 
 
 
577 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  24 
 
 
577 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  23.83 
 
 
576 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  23.68 
 
 
576 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  23.47 
 
 
576 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  25.91 
 
 
530 aa  91.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  24.74 
 
 
769 aa  87.4  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  25 
 
 
770 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  25.56 
 
 
770 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  25.28 
 
 
770 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  24.91 
 
 
770 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  25.72 
 
 
772 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  24.95 
 
 
769 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  23.99 
 
 
770 aa  77  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  23.02 
 
 
691 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  24.25 
 
 
769 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  23.66 
 
 
770 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  25.63 
 
 
768 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  25 
 
 
291 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  26.16 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  30.59 
 
 
238 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  34.29 
 
 
181 aa  64.3  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  27.03 
 
 
197 aa  63.9  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  28.19 
 
 
816 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  29.14 
 
 
300 aa  62  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  28.1 
 
 
816 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  23.9 
 
 
424 aa  60.5  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  26.11 
 
 
534 aa  60.5  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  28.19 
 
 
816 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  22.74 
 
 
720 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  22.75 
 
 
519 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  21.87 
 
 
720 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  21.87 
 
 
720 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  24.91 
 
 
332 aa  59.3  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  28.24 
 
 
240 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4520  hypothetical protein  30.88 
 
 
149 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  33.02 
 
 
757 aa  57  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  34.09 
 
 
178 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  32.08 
 
 
755 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  34.09 
 
 
178 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  21.56 
 
 
226 aa  55.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  26.56 
 
 
818 aa  54.3  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  28.83 
 
 
759 aa  54.3  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  24.64 
 
 
449 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  30.48 
 
 
838 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  31.67 
 
 
755 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  23.13 
 
 
722 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  24.34 
 
 
722 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  24.34 
 
 
722 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
351 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  20.96 
 
 
722 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  30.48 
 
 
836 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  28.65 
 
 
327 aa  51.6  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  26.95 
 
 
838 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  32 
 
 
180 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  29.52 
 
 
838 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  24.06 
 
 
684 aa  50.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  24.22 
 
 
203 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  24.18 
 
 
746 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  23.9 
 
 
354 aa  48.9  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  25.28 
 
 
829 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  25.28 
 
 
829 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  26.14 
 
 
828 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  23.17 
 
 
361 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0116  hypothetical protein  39.76 
 
 
351 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  25.84 
 
 
440 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2239  hypothetical protein  25.69 
 
 
154 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  24.54 
 
 
829 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  23.39 
 
 
621 aa  43.9  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5145  MORN variant repeat protein  26.83 
 
 
199 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.266583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>