89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1425 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  79.35 
 
 		 566 aa  907    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  76.04 
 
 		 566 aa  880    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  79 
 
 		 566 aa  905    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  100 
 
 		 580 aa  1181    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  76.04 
 
 		 566 aa  877    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  78.66 
 
 		 566 aa  905    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  74.13 
 
 		 566 aa  848    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  76.56 
 
 		 566 aa  880    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  83.85 
 
 		 566 aa  966    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  26.37 
 
 		 602 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  27.86 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  25.09 
 
 		 577 aa  170  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  25.67 
 
 		 577 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  25.96 
 
 		 576 aa  167  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  24.7 
 
 		 580 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  25.49 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  25.31 
 
 		 577 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  24.65 
 
 		 576 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  24.82 
 
 		 576 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  24.64 
 
 		 576 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  25.85 
 
 		 768 aa  90.5  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  26.89 
 
 		 772 aa  88.6  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  24.56 
 
 		 770 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  24.56 
 
 		 770 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  24.18 
 
 		 770 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  24.37 
 
 		 770 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  24.16 
 
 		 770 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  26.53 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  22.91 
 
 		 530 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  23.67 
 
 		 769 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  23.94 
 
 		 769 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  22.16 
 
 		 691 aa  71.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  21.89 
 
 		 769 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  24.3 
 
 		 770 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  29 
 
 		 240 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  26.51 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  28.44 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  29.55 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  29.31 
 
 		 816 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  27.35 
 
 		 818 aa  62  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  27.22 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  33.65 
 
 		 838 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  26.23 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  28.45 
 
 		 816 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  32.38 
 
 		 757 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  28.98 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  32.38 
 
 		 755 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  32.69 
 
 		 838 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  25.52 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  32.69 
 
 		 838 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  32.38 
 
 		 755 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  27.18 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  32.69 
 
 		 836 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  22.93 
 
 		 720 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  24.61 
 
 		 720 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  24.44 
 
 		 203 aa  55.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  24.61 
 
 		 720 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4520  hypothetical protein  34 
 
 		 149 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  30.3 
 
 		 440 aa  54.3  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  30.28 
 
 		 178 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  25.83 
 
 		 614 aa  53.5  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  27.07 
 
 		 746 aa  53.9  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  30.28 
 
 		 178 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  29.06 
 
 		 188 aa  53.5  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  21.47 
 
 		 332 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  27.78 
 
 		 180 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  20.25 
 
 		 226 aa  50.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  23.12 
 
 		 828 aa  50.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  23.56 
 
 		 829 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  23.56 
 
 		 829 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  24.47 
 
 		 327 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  23.08 
 
 		 829 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  31.09 
 
 		 621 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  23.84 
 
 		 424 aa  48.5  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  22.16 
 
 		 519 aa  47.4  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  21.86 
 
 		 722 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  21.86 
 
 		 722 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  22.27 
 
 		 722 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4778  hypothetical protein  24.24 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  22.86 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5145  MORN variant repeat protein  26.56 
 
 		 199 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.266583 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  27.21 
 
 		 684 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  23.23 
 
 		 361 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  26.09 
 
 		 171 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  25.37 
 
 		 722 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0593  MORN repeat-containing protein  37.29 
 
 		 158 aa  43.9  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>