40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0062 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  73.47 
 
 		 829 aa  1296    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  100 
 
 		 818 aa  1692    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  79.71 
 
 		 816 aa  1394    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  65.02 
 
 		 684 aa  876    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  79.83 
 
 		 816 aa  1396    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  73.47 
 
 		 829 aa  1297    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  79.58 
 
 		 816 aa  1392    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  73.47 
 
 		 829 aa  1297    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  73.68 
 
 		 828 aa  1295    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  25.95 
 
 		 691 aa  85.1  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  26.52 
 
 		 769 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  26.96 
 
 		 770 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  26.16 
 
 		 770 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.16 
 
 		 770 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0343  hypothetical protein  23.13 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  26.56 
 
 		 770 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  24.84 
 
 		 769 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  24.84 
 
 		 769 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  25.06 
 
 		 770 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  24.05 
 
 		 770 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  26.87 
 
 		 772 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  27.35 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  27.35 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  27.83 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  27.69 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  23.89 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  27.2 
 
 		 566 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  26.96 
 
 		 566 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  26.75 
 
 		 566 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  26.75 
 
 		 566 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  25.06 
 
 		 768 aa  55.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  24.81 
 
 		 454 aa  55.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  26.72 
 
 		 566 aa  54.7  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  26.36 
 
 		 720 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  25.91 
 
 		 720 aa  52  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  25.45 
 
 		 720 aa  51.2  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  25.43 
 
 		 566 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  27.43 
 
 		 240 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3699  hypothetical protein  26.4 
 
 		 568 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000308051 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  25.42 
 
 		 354 aa  44.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>