26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0343 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0343  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  889    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  23.06 
 
 		 818 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  22.35 
 
 		 816 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  22.79 
 
 		 816 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  22.52 
 
 		 684 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  22.52 
 
 		 816 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  23.79 
 
 		 828 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  22.85 
 
 		 829 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  22.6 
 
 		 829 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  22.57 
 
 		 829 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3012  MORN variant repeat protein  27.91 
 
 		 334 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  28.8 
 
 		 274 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  26.17 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  26.27 
 
 		 769 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  31.03 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  25.97 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  27.61 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  28.17 
 
 		 500 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  26.28 
 
 		 768 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  30.64 
 
 		 772 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  27.01 
 
 		 770 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  25.35 
 
 		 769 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  30.71 
 
 		 642 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  31.51 
 
 		 691 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  30.71 
 
 		 603 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  25.34 
 
 		 770 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>