51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2279 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  996    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  60.83 
 
 
500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1007  MORN repeat-containing protein  62.92 
 
 
501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2332  hypothetical protein  62.71 
 
 
501 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  58.35 
 
 
488 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  59.15 
 
 
507 aa  527  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  54.14 
 
 
468 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2389  MORN repeat-containing protein  39.64 
 
 
352 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  35.62 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  37.5 
 
 
350 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10093  predicted protein  38.22 
 
 
315 aa  190  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0975626  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10974  predicted protein  36.46 
 
 
312 aa  170  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  35.74 
 
 
577 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34720  predicted protein  33.21 
 
 
576 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11352  predicted protein  40.28 
 
 
211 aa  150  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0412501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  35.82 
 
 
575 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  35.38 
 
 
575 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19094  predicted protein  38.94 
 
 
226 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762529  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  37.83 
 
 
579 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  35.82 
 
 
603 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  35.82 
 
 
642 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  33.94 
 
 
575 aa  143  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  36.06 
 
 
577 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  35.13 
 
 
461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  35.45 
 
 
577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  37.08 
 
 
579 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3530  MORN repeat-containing protein  40.76 
 
 
202 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.364919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0849  MORN repeat-containing protein  37.31 
 
 
538 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.10958  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1013  MORN motif-containing protein  38.5 
 
 
245 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0633058  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10781  predicted protein  37.35 
 
 
160 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_850  predicted protein  30.51 
 
 
662 aa  100  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2559  MORN repeat-containing protein  35.79 
 
 
216 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0654  phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  31.1 
 
 
167 aa  91.3  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21704  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_944  predicted protein  40.59 
 
 
107 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30154  predicted protein  33.33 
 
 
172 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.82692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2278  hypothetical protein  32.88 
 
 
212 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0297  MORN repeat-containing protein  46.84 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  0.101065 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1911  hypothetical protein  39.51 
 
 
136 aa  64.7  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0051  MORN motif-containing protein  38.37 
 
 
126 aa  63.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000239093  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_95034  predicted protein  40 
 
 
505 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234943  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93578  predicted protein  37.37 
 
 
686 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000533165  normal  0.01596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  24.88 
 
 
519 aa  56.6  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2296  hypothetical protein  39.51 
 
 
106 aa  53.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000811573  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  33.94 
 
 
1319 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.499613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6615  MORN repeat-containing protein  35.48 
 
 
356 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0602  hypothetical protein  29.09 
 
 
385 aa  51.6  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26666  predicted protein  39.76 
 
 
325 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  27.31 
 
 
691 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0010  hypothetical protein  24.31 
 
 
398 aa  47.8  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0343  hypothetical protein  31.03 
 
 
429 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24687  predicted protein  32.85 
 
 
730 aa  43.5  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.818146  normal  0.14787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>