24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3001 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  57.23 
 
 		 828 aa  778    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  58.55 
 
 		 829 aa  790    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  63.96 
 
 		 816 aa  854    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  57.96 
 
 		 829 aa  786    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  64.26 
 
 		 816 aa  860    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  58.41 
 
 		 829 aa  793    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  100 
 
 		 684 aa  1411    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  65.02 
 
 		 818 aa  876    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  63.96 
 
 		 816 aa  854    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0343  hypothetical protein  22.52 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  26.39 
 
 		 449 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  25.76 
 
 		 691 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  24.74 
 
 		 769 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  21.27 
 
 		 768 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  25.11 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  25.64 
 
 		 566 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  24.48 
 
 		 291 aa  48.5  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  22.85 
 
 		 566 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  24.68 
 
 		 134 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  24.79 
 
 		 566 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  27.21 
 
 		 580 aa  45.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  23.23 
 
 		 534 aa  45.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  24.51 
 
 		 772 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  26.83 
 
 		 274 aa  43.9  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>