20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3699 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3699  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1186    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000308051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0598  hypothetical protein  26.02 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2734  putative lipoprotein  26.69 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000371316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0104  hypothetical protein  26.94 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.432499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  24.37 
 
 		 770 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  24.37 
 
 		 770 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  24.37 
 
 		 770 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  23.84 
 
 		 770 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  29.07 
 
 		 203 aa  52  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 		 722 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 		 722 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 		 722 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 		 722 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  26.32 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  23.65 
 
 		 240 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  26.32 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  26.32 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  26.4 
 
 		 818 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  23.99 
 
 		 332 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>