14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0598 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0598  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0104  hypothetical protein  31.77 
 
 		 390 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.432499  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2734  putative lipoprotein  30.38 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000371316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3699  hypothetical protein  26.02 
 
 		 568 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000308051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  30.4 
 
 		 720 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  31.25 
 
 		 720 aa  57  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 720 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  29.28 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  30.66 
 
 		 238 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3047  hypothetical protein  26.45 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  29.07 
 
 		 530 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  26.98 
 
 		 722 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  26.98 
 
 		 722 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  27.2 
 
 		 291 aa  42.7  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>