101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1911 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  100 
 
 
530 aa  1065    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  25.98 
 
 
691 aa  146  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  23.37 
 
 
772 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  29.94 
 
 
291 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  25.62 
 
 
769 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  23.95 
 
 
519 aa  127  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  25.24 
 
 
769 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  24.44 
 
 
770 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  25.46 
 
 
770 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  25.26 
 
 
770 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  22.53 
 
 
770 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  25.26 
 
 
770 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  25.24 
 
 
770 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  26.97 
 
 
534 aa  118  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  23.52 
 
 
769 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  29.92 
 
 
621 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  24.58 
 
 
449 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  25.12 
 
 
768 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  25.16 
 
 
746 aa  104  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  25.87 
 
 
454 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  27.64 
 
 
327 aa  95.9  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  22.27 
 
 
755 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  21.53 
 
 
757 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  36.36 
 
 
274 aa  92.8  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  25.75 
 
 
566 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  22.85 
 
 
755 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  25.91 
 
 
566 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  25.62 
 
 
720 aa  89.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  21.49 
 
 
759 aa  88.2  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  25.3 
 
 
566 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  24.22 
 
 
838 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  26.85 
 
 
722 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  26.85 
 
 
722 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  24.46 
 
 
836 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  28.51 
 
 
354 aa  87.8  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  24.43 
 
 
720 aa  86.7  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  24.22 
 
 
838 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  26.7 
 
 
720 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  23.98 
 
 
838 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  27.89 
 
 
722 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  27.89 
 
 
722 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  25.89 
 
 
577 aa  84  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  31.18 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  24.79 
 
 
577 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  24.22 
 
 
577 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  24.5 
 
 
577 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  25.08 
 
 
566 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  26.28 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  23.15 
 
 
566 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  24.79 
 
 
576 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  22.91 
 
 
580 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  24.19 
 
 
576 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  24.79 
 
 
576 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  25.66 
 
 
580 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  24.01 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  24.5 
 
 
576 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  23.4 
 
 
566 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  26.59 
 
 
332 aa  73.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  26.76 
 
 
180 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  23.4 
 
 
566 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  22.55 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  27.31 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  24.46 
 
 
602 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0116  hypothetical protein  26.74 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  30.25 
 
 
175 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  23.64 
 
 
238 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  27.4 
 
 
197 aa  63.9  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  27.73 
 
 
173 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  29.13 
 
 
203 aa  63.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  26.11 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  27.73 
 
 
175 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  24.71 
 
 
424 aa  61.6  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  27.83 
 
 
178 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  29.45 
 
 
171 aa  61.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  27.83 
 
 
178 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  24.29 
 
 
571 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  30.83 
 
 
188 aa  59.7  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  33.33 
 
 
159 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  27.73 
 
 
181 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  30.28 
 
 
440 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.53 
 
 
590 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  29.37 
 
 
203 aa  53.9  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  26.34 
 
 
507 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4778  hypothetical protein  24.26 
 
 
404 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
351 aa  50.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2734  putative lipoprotein  26.01 
 
 
278 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000371316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  30.52 
 
 
230 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  23.23 
 
 
614 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  27.72 
 
 
239 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2239  hypothetical protein  28.3 
 
 
154 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0942  hypothetical protein  29.21 
 
 
351 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770907  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0104  hypothetical protein  26.49 
 
 
390 aa  48.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.432499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1044  hypothetical protein  32.31 
 
 
352 aa  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  27.96 
 
 
134 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0761  hypothetical protein  25.94 
 
 
823 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.132602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5145  MORN variant repeat protein  33.33 
 
 
199 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.266583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0598  hypothetical protein  29.07 
 
 
342 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  29.63 
 
 
187 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4388  hypothetical protein  26.73 
 
 
108 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748198  normal  0.178906 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0010  hypothetical protein  34.94 
 
 
398 aa  43.5  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>