69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1003 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  73.28 
 
 
577 aa  885    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  77.37 
 
 
576 aa  922    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  78.41 
 
 
576 aa  935    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  70.22 
 
 
580 aa  855    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  63.56 
 
 
571 aa  721    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  78.07 
 
 
576 aa  933    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  72.59 
 
 
577 aa  871    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  72.24 
 
 
577 aa  873    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  100 
 
 
577 aa  1192    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  57.17 
 
 
576 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  31.4 
 
 
602 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  25.23 
 
 
566 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  25.42 
 
 
566 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  25.05 
 
 
566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  26.02 
 
 
566 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  25.14 
 
 
566 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  25.19 
 
 
566 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  25.31 
 
 
566 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  24.38 
 
 
580 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  24.78 
 
 
566 aa  158  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  25.89 
 
 
530 aa  84  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  24.35 
 
 
449 aa  67  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  24.21 
 
 
772 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  28.32 
 
 
226 aa  62  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  25.07 
 
 
291 aa  59.7  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  29.13 
 
 
361 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  27.8 
 
 
454 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  26.37 
 
 
720 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  26.37 
 
 
720 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  26.91 
 
 
332 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  25.71 
 
 
691 aa  55.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  23.59 
 
 
768 aa  54.7  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  25.87 
 
 
720 aa  54.3  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  23.91 
 
 
519 aa  54.3  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  21.33 
 
 
770 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  25.57 
 
 
327 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  23.8 
 
 
770 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  25.94 
 
 
354 aa  52.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  21.51 
 
 
769 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  23.17 
 
 
770 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  24.01 
 
 
769 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  27.07 
 
 
746 aa  51.2  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  24.01 
 
 
769 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  33.73 
 
 
440 aa  50.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4778  hypothetical protein  25.33 
 
 
404 aa  50.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  21.02 
 
 
770 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  24.36 
 
 
722 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  29.76 
 
 
134 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 
722 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  38.64 
 
 
178 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 
722 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  25 
 
 
621 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  24.36 
 
 
722 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  26.86 
 
 
816 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  21.21 
 
 
770 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  23.83 
 
 
770 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  26.86 
 
 
816 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  24.71 
 
 
240 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  39.53 
 
 
178 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  23.38 
 
 
239 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1044  hypothetical protein  27.75 
 
 
352 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  25.35 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  26.86 
 
 
816 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  24.32 
 
 
838 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  18.36 
 
 
755 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  18.76 
 
 
755 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  28.57 
 
 
230 aa  44.3  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  27.88 
 
 
159 aa  44.3  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  26.45 
 
 
203 aa  43.9  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>