62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0831 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  72.24 
 
 		 577 aa  873    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  59.28 
 
 		 580 aa  712    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  84 
 
 		 576 aa  996    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  83.36 
 
 		 576 aa  994    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  100 
 
 		 577 aa  1192    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  83.13 
 
 		 576 aa  985    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  64.52 
 
 		 571 aa  744    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  98.27 
 
 		 577 aa  1175    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  96.36 
 
 		 577 aa  1152    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  54.35 
 
 		 576 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  30.76 
 
 		 602 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  26.31 
 
 		 566 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  26.31 
 
 		 566 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  25.93 
 
 		 566 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  25.56 
 
 		 566 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  25.75 
 
 		 566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  24.63 
 
 		 566 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  24.15 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  23.51 
 
 		 566 aa  156  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  24.59 
 
 		 580 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  24.22 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  22.84 
 
 		 769 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  25.06 
 
 		 772 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  30.06 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  24.5 
 
 		 770 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  29.32 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  24.63 
 
 		 770 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  25.16 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  23.02 
 
 		 770 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  25.22 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  21.11 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  22.83 
 
 		 770 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  21.9 
 
 		 770 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  22.68 
 
 		 770 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  22.22 
 
 		 768 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  28.64 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  23.49 
 
 		 240 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  25.06 
 
 		 769 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  24.94 
 
 		 769 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  22.85 
 
 		 691 aa  54.3  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  26.99 
 
 		 332 aa  53.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  27.38 
 
 		 134 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  32.61 
 
 		 440 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  38.55 
 
 		 178 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  22.83 
 
 		 720 aa  50.4  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  42.42 
 
 		 178 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  22.83 
 
 		 720 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  22.54 
 
 		 720 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  24.06 
 
 		 327 aa  47.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  23.44 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  25.5 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  31.52 
 
 		 614 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  21.89 
 
 		 722 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1044  hypothetical protein  26.59 
 
 		 352 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  20.87 
 
 		 722 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  26.26 
 
 		 746 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  22.35 
 
 		 238 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4778  hypothetical protein  23.91 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  25.15 
 
 		 757 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  25.15 
 
 		 755 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  27.06 
 
 		 274 aa  44.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  25.58 
 
 		 239 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>