56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0141 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  57.17 
 
 		 577 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  56.23 
 
 		 580 aa  646    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1196    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  54.88 
 
 		 577 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  54.35 
 
 		 577 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  54.71 
 
 		 577 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  53.45 
 
 		 576 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  53.45 
 
 		 576 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  53.27 
 
 		 576 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  44.25 
 
 		 571 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  30.3 
 
 		 602 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  26.43 
 
 		 566 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  26.62 
 
 		 566 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  26.25 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  26.34 
 
 		 566 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  25.54 
 
 		 566 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  25.32 
 
 		 566 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  24.64 
 
 		 566 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  24.41 
 
 		 566 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  25.54 
 
 		 580 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  24.19 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  24.59 
 
 		 768 aa  67  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  24.95 
 
 		 772 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  24.74 
 
 		 770 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  25.79 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  24.47 
 
 		 770 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  24.47 
 
 		 770 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  23.93 
 
 		 770 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  22.83 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  22 
 
 		 770 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  22.75 
 
 		 770 aa  57.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  22.85 
 
 		 769 aa  57.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  23.93 
 
 		 769 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  23.93 
 
 		 769 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  24.27 
 
 		 720 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  24.27 
 
 		 720 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  24.27 
 
 		 720 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  21.56 
 
 		 691 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  24.57 
 
 		 519 aa  51.2  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  25.57 
 
 		 454 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  24.18 
 
 		 226 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  26.11 
 
 		 332 aa  50.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  24.39 
 
 		 746 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  27.38 
 
 		 134 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  26.82 
 
 		 188 aa  47.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  23.37 
 
 		 291 aa  47.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  23.86 
 
 		 240 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0610  hypothetical protein  31.76 
 
 		 262 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  24.91 
 
 		 621 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  23.53 
 
 		 722 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  26.45 
 
 		 440 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  20.21 
 
 		 755 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  23.53 
 
 		 722 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  21.78 
 
 		 759 aa  44.3  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  23.53 
 
 		 722 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  23.53 
 
 		 722 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>