28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4778 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4778  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  827    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  29.57 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  24.51 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  24.51 
 
 		 566 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  23.86 
 
 		 566 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  31.76 
 
 		 746 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  25.33 
 
 		 577 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  24.26 
 
 		 530 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  21.17 
 
 		 759 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  22.19 
 
 		 566 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  24.24 
 
 		 580 aa  46.6  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  20.28 
 
 		 602 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  26.73 
 
 		 580 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  24.69 
 
 		 720 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  24.07 
 
 		 720 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  31.58 
 
 		 838 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  18.96 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  24.07 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  32.14 
 
 		 755 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  32.14 
 
 		 755 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  23.98 
 
 		 577 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  24.1 
 
 		 577 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  21.93 
 
 		 691 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  26.06 
 
 		 770 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  24.89 
 
 		 566 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2239  hypothetical protein  28.83 
 
 		 154 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  24.42 
 
 		 772 aa  43.1  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  31.65 
 
 		 188 aa  43.1  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>