27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2460 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  719    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0116  hypothetical protein  44.13 
 
 		 351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1044  hypothetical protein  38.86 
 
 		 352 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  26.11 
 
 		 530 aa  63.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  24.27 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  27.45 
 
 		 440 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  23.02 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  26.28 
 
 		 580 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  26.85 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  24.87 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  30.6 
 
 		 759 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  21.6 
 
 		 691 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  25.65 
 
 		 534 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  27.27 
 
 		 614 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  32.26 
 
 		 757 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  25.71 
 
 		 181 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  29.55 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  31.61 
 
 		 755 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  23.79 
 
 		 838 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  24.11 
 
 		 720 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  26.76 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  24.11 
 
 		 720 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  23.89 
 
 		 838 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  27.31 
 
 		 772 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  31.61 
 
 		 755 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  24.26 
 
 		 291 aa  42.7  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  23.2 
 
 		 576 aa  42.7  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>