72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0819 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  100 
 
 
159 aa  328  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  29.13 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  29.17 
 
 
291 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  28.35 
 
 
354 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  29.46 
 
 
621 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  33.33 
 
 
530 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  27.14 
 
 
230 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  28.95 
 
 
519 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  24.52 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  28.07 
 
 
361 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  29.79 
 
 
770 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0942  hypothetical protein  25.78 
 
 
351 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770907  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  27.27 
 
 
691 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  27.27 
 
 
836 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  29.79 
 
 
770 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  25.23 
 
 
188 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  29.79 
 
 
770 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  26.56 
 
 
327 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  27.85 
 
 
772 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  32.67 
 
 
449 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  26.73 
 
 
838 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  27.27 
 
 
838 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  27.5 
 
 
440 aa  48.5  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  28.45 
 
 
134 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  27.27 
 
 
838 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  32.89 
 
 
274 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  27.36 
 
 
332 aa  48.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  27.5 
 
 
614 aa  47.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  25.74 
 
 
770 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  27.84 
 
 
203 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  22.58 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  22.36 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  28.72 
 
 
770 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  28.12 
 
 
576 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01955  hypothetical protein  31.58 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2296  hypothetical protein  39.36 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000811573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  28.12 
 
 
576 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  27.08 
 
 
239 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  25.48 
 
 
769 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  24.76 
 
 
746 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  27.93 
 
 
240 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  30.21 
 
 
722 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
351 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  25.93 
 
 
454 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  27.88 
 
 
577 aa  44.3  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  30.77 
 
 
769 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  22.99 
 
 
770 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  29.17 
 
 
722 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  30.43 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  26.56 
 
 
576 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6615  MORN repeat-containing protein  33.75 
 
 
356 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5579  hypothetical protein  37.04 
 
 
275 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  25.78 
 
 
577 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  25.78 
 
 
577 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  20.61 
 
 
720 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  25.53 
 
 
571 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2294  hypothetical protein  31.48 
 
 
143 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0453403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  25.78 
 
 
577 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  30.59 
 
 
534 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  29.17 
 
 
722 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  23.18 
 
 
720 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  28.05 
 
 
769 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  23.18 
 
 
720 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  32.53 
 
 
768 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  29.35 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  29.17 
 
 
722 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  23.73 
 
 
178 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  28.24 
 
 
580 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  23.73 
 
 
178 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  25.24 
 
 
757 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0761  hypothetical protein  24.04 
 
 
823 aa  40.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.132602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  23.71 
 
 
759 aa  40.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>