65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00975 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  39.91 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  32.11 
 
 
621 aa  69.3  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  31.36 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  29.55 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  27.27 
 
 
768 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  32.43 
 
 
171 aa  62.4  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  28.78 
 
 
772 aa  62.4  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  25.68 
 
 
449 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  30.59 
 
 
178 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  27.49 
 
 
691 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  29.41 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  30.59 
 
 
720 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  29.93 
 
 
770 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  30.59 
 
 
720 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  29.93 
 
 
770 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  23.38 
 
 
240 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  34.65 
 
 
769 aa  55.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  26.71 
 
 
770 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  27.61 
 
 
770 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  23.11 
 
 
769 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  27.14 
 
 
159 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  29.08 
 
 
571 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  29.2 
 
 
770 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  36.73 
 
 
291 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  25.62 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  27.81 
 
 
354 aa  53.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  29.41 
 
 
720 aa  52.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  25.16 
 
 
769 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  25.94 
 
 
519 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  36.04 
 
 
361 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  22.69 
 
 
770 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  30.52 
 
 
530 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  28.06 
 
 
816 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  31.96 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  25.87 
 
 
602 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  24.77 
 
 
816 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  29.13 
 
 
454 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  29.03 
 
 
534 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  23.21 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4388  hypothetical protein  28.26 
 
 
108 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748198  normal  0.178906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  26.35 
 
 
576 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3367  hypothetical protein  32.53 
 
 
152 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379877  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  27.34 
 
 
816 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  25.38 
 
 
188 aa  45.1  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  25.77 
 
 
134 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01955  hypothetical protein  41.51 
 
 
112 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  31.25 
 
 
722 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  28.57 
 
 
577 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
351 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  27.01 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  31.25 
 
 
722 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  31.25 
 
 
722 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  31.25 
 
 
722 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  28.36 
 
 
300 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  27.18 
 
 
566 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  25 
 
 
576 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  25.89 
 
 
180 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  30.21 
 
 
566 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  25 
 
 
576 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  26.61 
 
 
580 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  27.27 
 
 
566 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  27.27 
 
 
566 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  25.83 
 
 
580 aa  41.6  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  27.27 
 
 
566 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>