54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2335 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  30.65 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  26.23 
 
 		 722 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  26.23 
 
 		 722 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  26.23 
 
 		 722 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  26.23 
 
 		 722 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  31.13 
 
 		 770 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  29.37 
 
 		 530 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  25.67 
 
 		 534 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  30.19 
 
 		 770 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  30.19 
 
 		 770 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  31.65 
 
 		 759 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  30.19 
 
 		 770 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  29.3 
 
 		 691 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  31.13 
 
 		 769 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  31.13 
 
 		 770 aa  52  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  31.4 
 
 		 291 aa  51.6  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  30.77 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  30.19 
 
 		 769 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  31.13 
 
 		 770 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  28.46 
 
 		 354 aa  48.9  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  30.32 
 
 		 755 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  31.37 
 
 		 327 aa  48.5  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  30.09 
 
 		 772 aa  48.5  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  26.62 
 
 		 720 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  28.95 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  29.82 
 
 		 769 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  26.62 
 
 		 720 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  25.97 
 
 		 720 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  27.84 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  29.03 
 
 		 755 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  29.27 
 
 		 519 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  25.48 
 
 		 602 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  24.68 
 
 		 768 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  27.81 
 
 		 274 aa  45.1  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  28.32 
 
 		 238 aa  45.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  30.36 
 
 		 838 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  32.73 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  29.87 
 
 		 454 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  24.67 
 
 		 332 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  28.28 
 
 		 449 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  28.39 
 
 		 757 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  23.68 
 
 		 746 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  24.34 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  30.85 
 
 		 838 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  28.36 
 
 		 838 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  27.45 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  30.77 
 
 		 621 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  24.65 
 
 		 829 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  25.35 
 
 		 829 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 545 aa  41.2  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.7656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>