57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4395 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  345  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  97.44 
 
 
173 aa  303  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  92.86 
 
 
175 aa  287  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4388  hypothetical protein  55.77 
 
 
108 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748198  normal  0.178906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  28.33 
 
 
770 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  29.46 
 
 
769 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  29.46 
 
 
769 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  26.67 
 
 
770 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  29.92 
 
 
768 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  27.12 
 
 
770 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  27.12 
 
 
770 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  27.12 
 
 
770 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  26.27 
 
 
770 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  25.45 
 
 
769 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  27.73 
 
 
530 aa  64.3  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  36.04 
 
 
449 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  26.73 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  27.78 
 
 
621 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  28.07 
 
 
691 aa  58.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  29.35 
 
 
274 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  25.69 
 
 
519 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  29.25 
 
 
534 aa  54.3  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  27.42 
 
 
300 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  26.73 
 
 
361 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  27.68 
 
 
772 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  25.23 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0610  hypothetical protein  25.93 
 
 
262 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0942  hypothetical protein  30.14 
 
 
351 aa  52.4  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770907  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  26.32 
 
 
327 aa  51.6  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  23.64 
 
 
291 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  27.14 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  27.88 
 
 
197 aa  48.5  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  23.85 
 
 
332 aa  47.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  22.88 
 
 
203 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  31.4 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
351 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1250  hypothetical protein  30.14 
 
 
115 aa  44.3  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220224  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  25.97 
 
 
722 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  25.97 
 
 
722 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  30.56 
 
 
722 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  30.56 
 
 
722 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5689  hypothetical protein  25.51 
 
 
357 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  27.17 
 
 
577 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  27.17 
 
 
577 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  27.17 
 
 
577 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  32.89 
 
 
838 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  32.89 
 
 
838 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  32.89 
 
 
838 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3784  hypothetical protein  28.12 
 
 
338 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118303  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  24.43 
 
 
187 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  25.45 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  28.57 
 
 
134 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  32.84 
 
 
836 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1108  hypothetical protein  26.67 
 
 
176 aa  41.2  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000270207  hitchhiker  0.00000000131688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  26.42 
 
 
440 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1044  hypothetical protein  25.22 
 
 
352 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01955  hypothetical protein  28.57 
 
 
112 aa  40.8  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>