21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1108 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1108  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  353  7.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000270207  hitchhiker  0.00000000131688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0610  hypothetical protein  35.77 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3190  hypothetical protein  34.45 
 
 		 272 aa  68.2  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00644171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  34.15 
 
 		 449 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  40.51 
 
 		 772 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  32.91 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  28.57 
 
 		 768 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  29.03 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  37.5 
 
 		 769 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4388  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748198  normal  0.178906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  32.43 
 
 		 180 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  29.07 
 
 		 770 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  29.07 
 
 		 770 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  32.58 
 
 		 361 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5689  hypothetical protein  33.66 
 
 		 357 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  31.31 
 
 		 770 aa  41.2  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0761  hypothetical protein  29.75 
 
 		 823 aa  41.2  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.132602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  36.11 
 
 		 770 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  34.72 
 
 		 769 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  34.72 
 
 		 769 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  35.82 
 
 		 197 aa  40.8  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.298933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>