More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0412 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0412  Sel1  100 
 
 
193 aa  393  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0373  hypothetical protein  97.41 
 
 
193 aa  386  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.784905  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2060  Sel1 domain-containing protein  75.65 
 
 
193 aa  308  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571275  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 
557 aa  97.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  42.61 
 
 
684 aa  90.5  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.43 
 
 
318 aa  88.2  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  38.69 
 
 
490 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  36.94 
 
 
235 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  38.69 
 
 
490 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.24 
 
 
1012 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  43.12 
 
 
256 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  41.53 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  45.54 
 
 
789 aa  85.9  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.02 
 
 
831 aa  83.6  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.7 
 
 
489 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36 
 
 
1402 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  35.76 
 
 
1877 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.89 
 
 
346 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  33.33 
 
 
961 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.37 
 
 
2413 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  41.74 
 
 
1493 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  38.94 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  42.98 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.35 
 
 
1226 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  40.18 
 
 
448 aa  79  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.97 
 
 
425 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  41.9 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.13 
 
 
325 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  47.13 
 
 
325 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  43.12 
 
 
1032 aa  78.2  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.12 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  38.06 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.97 
 
 
528 aa  75.5  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.72 
 
 
1261 aa  75.5  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.75 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.82 
 
 
416 aa  75.5  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  34.25 
 
 
234 aa  74.7  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  39.5 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.8 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  45.98 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  31.18 
 
 
913 aa  73.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  45.98 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  37.93 
 
 
838 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.37 
 
 
1037 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  44.83 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  36.36 
 
 
1160 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.48 
 
 
376 aa  72  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  40.37 
 
 
342 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  37.61 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  32.03 
 
 
978 aa  71.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  33.06 
 
 
1059 aa  71.2  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  38.14 
 
 
1003 aa  71.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 
976 aa  71.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  40.43 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.62 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  36.59 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  38.84 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  41.28 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  27.8 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  39.23 
 
 
1475 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.8 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.85 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  36.67 
 
 
1141 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  31.14 
 
 
1086 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.47 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.17 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  41.38 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  35.9 
 
 
720 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  35.9 
 
 
720 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  35.9 
 
 
720 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.9 
 
 
380 aa  68.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.94 
 
 
1072 aa  68.6  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.32 
 
 
1260 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 
1430 aa  68.6  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  40.18 
 
 
971 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  35.19 
 
 
1134 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.18 
 
 
971 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.62 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  34.55 
 
 
685 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  37.5 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.83 
 
 
1263 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  37.17 
 
 
337 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
260 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  42.05 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.3 
 
 
997 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35 
 
 
731 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  35.65 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  34.71 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.7 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  37.61 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  34.26 
 
 
1105 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  33.88 
 
 
679 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  36.3 
 
 
1002 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.98 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  40.21 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.88 
 
 
1110 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>