More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3402 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  95.16 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  81.82 
 
 		 252 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  65.42 
 
 		 236 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  69.74 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  50.53 
 
 		 233 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  51.11 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  51.63 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  51.63 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  51.63 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  51.09 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  54.14 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  48.5 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  48.5 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  51.09 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  50.32 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  49.07 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  48.15 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  48.15 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  48.15 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  49.03 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  48.15 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.54 
 
 		 557 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.79 
 
 		 490 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.91 
 
 		 2413 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  36.79 
 
 		 490 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  40.59 
 
 		 831 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  37.3 
 
 		 684 aa  117  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  41.56 
 
 		 393 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  42.59 
 
 		 489 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.55 
 
 		 789 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.11 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.7 
 
 		 838 aa  112  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  36.02 
 
 		 961 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.65 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.71 
 
 		 425 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35.61 
 
 		 1493 aa  108  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  36.63 
 
 		 376 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  40.98 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  36.63 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1037 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  35.56 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.98 
 
 		 685 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1402 aa  104  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 303 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.99 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.98 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 976 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.16 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  32.58 
 
 		 342 aa  98.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.6 
 
 		 208 aa  98.6  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.94 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 1032 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  38.67 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.15 
 
 		 341 aa  96.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.27 
 
 		 1012 aa  96.3  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.26 
 
 		 416 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.22 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.29 
 
 		 392 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 482 aa  95.1  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 		 448 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  35.9 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.87 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  34.38 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.2 
 
 		 380 aa  92.8  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  32.37 
 
 		 348 aa  93.2  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  34.27 
 
 		 1141 aa  92.8  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  33.52 
 
 		 293 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.65 
 
 		 865 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.59 
 
 		 593 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1110 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  37.91 
 
 		 1059 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33.53 
 
 		 523 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.46 
 
 		 346 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.09 
 
 		 373 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33.95 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  37.2 
 
 		 304 aa  89.4  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.74 
 
 		 890 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.95 
 
 		 731 aa  89.4  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1002 aa  89  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  35.87 
 
 		 315 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2296  Sel1 domain-containing protein  34.87 
 
 		 342 aa  88.6  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.33 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  27.91 
 
 		 373 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  37.84 
 
 		 763 aa  88.2  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.63 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  36.48 
 
 		 1877 aa  88.2  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  36.2 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.57 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  39.84 
 
 		 680 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  35.71 
 
 		 509 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  37.57 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  35.71 
 
 		 509 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  35.59 
 
 		 464 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  35.95 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.27 
 
 		 343 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>