282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1754 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1754  Sel1-like  100 
 
 
273 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  89.88 
 
 
256 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2765  Sel1-like protein  75.56 
 
 
273 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  82.33 
 
 
267 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3203  Sel1 domain protein repeat-containing protein  76.09 
 
 
273 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2805  Sel1  83.19 
 
 
273 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.513793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4455  putative exopolysaccharide regulatory protein exoR  76.09 
 
 
240 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4238  Sel1 domain-containing protein  55.52 
 
 
310 aa  281  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204319  normal  0.875894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.61 
 
 
290 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  56.63 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  53.5 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  53.5 
 
 
295 aa  215  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  53 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2923  Sel1 domain-containing protein  52.97 
 
 
300 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1863  Sel1 domain-containing protein  43.93 
 
 
342 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1685  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.84 
 
 
280 aa  195  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132185 
 
 
-
 
NC_004310  BR0872  exopolysacchride production negative regulator exoR  38.2 
 
 
267 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0863  exopolysacchride production negative regulator exoR  38.2 
 
 
267 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  34.47 
 
 
267 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2681  exopolysaccharide production negative regulator  38.86 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1687  Sel1 repeat-containing protein  40.95 
 
 
268 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2356  Sel1 domain-containing protein  34.96 
 
 
263 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1478  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.32 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1676  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.32 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.2 
 
 
1402 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  30.93 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.9 
 
 
1037 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.39 
 
 
890 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.3 
 
 
684 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.33 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.78 
 
 
376 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  29.38 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.67 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.93 
 
 
789 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.75 
 
 
2413 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  28.95 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.13 
 
 
490 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  34.3 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  29.84 
 
 
373 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.06 
 
 
961 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.52 
 
 
831 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.73 
 
 
1012 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  30.53 
 
 
693 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.68 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  30.68 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  35.37 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.84 
 
 
373 aa  65.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.25 
 
 
528 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  34.56 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.16 
 
 
838 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.06 
 
 
393 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.25 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.17 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.73 
 
 
342 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  27.03 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 
303 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  31.03 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  28.97 
 
 
557 aa  62.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.41 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  31.1 
 
 
1160 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.34 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.95 
 
 
425 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0920  Sel1 domain-containing protein  41.58 
 
 
159 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.05 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  32.76 
 
 
1059 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  25.81 
 
 
482 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.03 
 
 
163 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  33.76 
 
 
384 aa  59.7  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  30.54 
 
 
489 aa  59.7  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  36.94 
 
 
221 aa  59.7  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  27.69 
 
 
839 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  32.04 
 
 
350 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  35.81 
 
 
680 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.74 
 
 
231 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.12 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.91 
 
 
346 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.57 
 
 
1493 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  31.61 
 
 
185 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  27.23 
 
 
679 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.48 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  32.73 
 
 
410 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.43 
 
 
322 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
448 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.64 
 
 
341 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.77 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.87 
 
 
1877 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  27.59 
 
 
245 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  27.08 
 
 
344 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  27.69 
 
 
305 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.18 
 
 
512 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  26.24 
 
 
368 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
1032 aa  55.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  44.93 
 
 
295 aa  55.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  30.06 
 
 
235 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.28 
 
 
347 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  25.71 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.54 
 
 
811 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  28.3 
 
 
175 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.52 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>