More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0863 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0906  Sel1 domain-containing protein  94.74 
 
 		 249 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0893  Sel1 domain-containing protein  94.74 
 
 		 249 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.131651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4315  Sel1 domain-containing protein  90.32 
 
 		 249 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0800  Sel1 repeat-containing protein  59.75 
 
 		 252 aa  265  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5130  hypothetical protein  57.26 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0219324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58600  hypothetical protein  56.85 
 
 		 271 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12410  tetratricopeptide-like helical protein  56.33 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0991  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.76 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.659562  normal  0.202953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  47.03 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  43.1 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3794  Sel1 domain-containing protein  47.52 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889747 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0199  hypothetical protein  48.98 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1689  TPR repeat-containing protein  48.98 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1608  hypothetical protein  49.49 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0793  hypothetical protein  44.78 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.303568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0893  TPR repeat-containing protein  46.27 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0664052  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1202  hypothetical protein  45.85 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4713  Sel1 domain-containing protein  46.27 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.767637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4191  Sel1 domain-containing protein  45.77 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5474  Sel1 domain-containing protein  45.71 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal  0.0666513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3558  Sel1 repeat-containing protein  45.71 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4809  Sel1 domain-containing protein  45.71 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1950  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.95 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.13 
 
 		 328 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0100  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.86 
 
 		 256 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.334736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4024  Sel1 domain-containing protein  40.67 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.32 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.7 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.78 
 
 		 489 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.81 
 
 		 1493 aa  94.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 1032 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.64 
 
 		 359 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.66 
 
 		 1402 aa  93.2  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  36.13 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.34 
 
 		 684 aa  92  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.84 
 
 		 685 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.33 
 
 		 376 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.86 
 
 		 961 aa  89.4  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34 
 
 		 528 aa  89  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.55 
 
 		 305 aa  89  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.24 
 
 		 392 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.33 
 
 		 376 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.5 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.38 
 
 		 831 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  35.38 
 
 		 557 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32.43 
 
 		 490 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 976 aa  85.9  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 318 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.43 
 
 		 490 aa  85.1  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.36 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  34.5 
 
 		 789 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.57 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  33.84 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.7 
 
 		 373 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.57 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.42 
 
 		 593 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.78 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 		 448 aa  79  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  33.15 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1037 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  32.95 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  39.33 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  31.76 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.73 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  32.64 
 
 		 591 aa  75.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  33.73 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.96 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.95 
 
 		 380 aa  75.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.19 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1877 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.89 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.54 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  32.53 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.73 
 
 		 731 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.35 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  27.62 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.79 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  29.59 
 
 		 552 aa  72  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  33.84 
 
 		 505 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.17 
 
 		 2413 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  29.03 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.82 
 
 		 565 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  32.29 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  32.65 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  32.14 
 
 		 839 aa  68.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  27.98 
 
 		 838 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  27.22 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  32.91 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  31.33 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  34.44 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  27.22 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.28 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 705 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>