More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0991 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0991  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
239 aa  477  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.659562  normal  0.202953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0800  Sel1 repeat-containing protein  51.54 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  46.82 
 
 
254 aa  201  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0199  hypothetical protein  50.89 
 
 
248 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1689  TPR repeat-containing protein  50.89 
 
 
248 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1202  hypothetical protein  51.34 
 
 
247 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3794  Sel1 domain-containing protein  49.09 
 
 
251 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889747 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1608  hypothetical protein  50.89 
 
 
248 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4191  Sel1 domain-containing protein  48.64 
 
 
251 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4713  Sel1 domain-containing protein  49.09 
 
 
251 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.767637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5474  Sel1 domain-containing protein  48.2 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal  0.0666513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3558  Sel1 repeat-containing protein  48.2 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4809  Sel1 domain-containing protein  48.2 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.76 
 
 
256 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0893  Sel1 domain-containing protein  50.24 
 
 
249 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.131651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0906  Sel1 domain-containing protein  48.42 
 
 
249 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0760134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0793  hypothetical protein  47.14 
 
 
254 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.303568  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0893  TPR repeat-containing protein  48.18 
 
 
257 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0664052  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4315  Sel1 domain-containing protein  49.76 
 
 
249 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  42.34 
 
 
307 aa  181  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5130  hypothetical protein  47.81 
 
 
271 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0219324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12410  tetratricopeptide-like helical protein  48.68 
 
 
253 aa  175  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58600  hypothetical protein  45.92 
 
 
271 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4024  Sel1 domain-containing protein  42.92 
 
 
250 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1950  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.41 
 
 
245 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.37 
 
 
233 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.97 
 
 
328 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0100  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.45 
 
 
256 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.334736  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.55 
 
 
253 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.84 
 
 
489 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  33 
 
 
831 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  37.24 
 
 
1032 aa  112  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.5 
 
 
1402 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.66 
 
 
305 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.51 
 
 
684 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  37.76 
 
 
255 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32.02 
 
 
490 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.71 
 
 
1493 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.02 
 
 
490 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.94 
 
 
557 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.87 
 
 
256 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.3 
 
 
392 aa  101  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.79 
 
 
235 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.78 
 
 
464 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 
252 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.55 
 
 
961 aa  99.8  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.99 
 
 
373 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.79 
 
 
789 aa  97.8  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.31 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  36.56 
 
 
416 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.47 
 
 
373 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  40.37 
 
 
359 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.65 
 
 
393 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
976 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.06 
 
 
376 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.79 
 
 
1037 aa  93.2  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.84 
 
 
685 aa  93.2  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.38 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.28 
 
 
376 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.5 
 
 
343 aa  92.4  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.34 
 
 
267 aa  92  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.68 
 
 
325 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  32.68 
 
 
325 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.59 
 
 
838 aa  91.3  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.65 
 
 
318 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.98 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.38 
 
 
341 aa  89.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.53 
 
 
528 aa  88.6  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.36 
 
 
278 aa  88.6  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31 
 
 
865 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  36.99 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.38 
 
 
380 aa  87  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  31.79 
 
 
185 aa  87  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  34.83 
 
 
325 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  35.95 
 
 
285 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.74 
 
 
346 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
303 aa  85.5  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.9 
 
 
523 aa  85.5  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  32.69 
 
 
274 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.2 
 
 
1877 aa  85.5  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  34.83 
 
 
327 aa  85.1  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  30.91 
 
 
331 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 
448 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.67 
 
 
552 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  30.86 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  37.42 
 
 
358 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  31.1 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30 
 
 
2413 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  30.3 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.41 
 
 
1012 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.53 
 
 
425 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  38.52 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.11 
 
 
1002 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.13 
 
 
316 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  32.72 
 
 
380 aa  82  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.33 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29 
 
 
890 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  33.68 
 
 
1200 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  34.59 
 
 
978 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>