More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1950 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1950  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0991  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.29 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.659562  normal  0.202953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0800  Sel1 repeat-containing protein  43.06 
 
 		 252 aa  154  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.26 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4315  Sel1 domain-containing protein  44.79 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0906  Sel1 domain-containing protein  44.74 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  41.09 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0893  Sel1 domain-containing protein  45.26 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.131651 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3794  Sel1 domain-containing protein  40.81 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889747 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1202  hypothetical protein  44.79 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.86 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0199  hypothetical protein  43.23 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  43 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1689  TPR repeat-containing protein  43.23 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4191  Sel1 domain-containing protein  40.36 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5130  hypothetical protein  43.63 
 
 		 271 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0219324  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4713  Sel1 domain-containing protein  40.36 
 
 		 251 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.767637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58600  hypothetical protein  47.54 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5474  Sel1 domain-containing protein  39.91 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal  0.0666513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3558  Sel1 repeat-containing protein  39.91 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4809  Sel1 domain-containing protein  39.91 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0893  TPR repeat-containing protein  39.01 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0664052  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12410  tetratricopeptide-like helical protein  47.85 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1608  hypothetical protein  43.23 
 
 		 248 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0793  hypothetical protein  38.12 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.303568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4024  Sel1 domain-containing protein  40.74 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0100  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.29 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.334736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.12 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.56 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  32.54 
 
 		 831 aa  99  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.83 
 
 		 489 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.93 
 
 		 490 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.1 
 
 		 490 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  32.66 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.68 
 
 		 392 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.34 
 
 		 557 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1402 aa  85.5  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.22 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.17 
 
 		 685 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  36.5 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.7 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.52 
 
 		 684 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.25 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1493 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.63 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.46 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.5 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.57 
 
 		 373 aa  78.6  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  35.38 
 
 		 478 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.32 
 
 		 961 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.37 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.63 
 
 		 528 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.86 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.85 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.65 
 
 		 890 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  28.71 
 
 		 482 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 1430 aa  75.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.79 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  29.49 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.61 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.7 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  28.66 
 
 		 731 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 1032 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.76 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  36.15 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  27.81 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  32.83 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  34.88 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.79 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.73 
 
 		 231 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  26.83 
 
 		 789 aa  72  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  27.78 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  29.48 
 
 		 693 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1877 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  31.58 
 
 		 763 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.38 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  27.92 
 
 		 850 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  30.2 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.7 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.25 
 
 		 1263 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  29.26 
 
 		 358 aa  68.9  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.41 
 
 		 425 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.25 
 
 		 838 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  28.14 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.11 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  31.21 
 
 		 680 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1037 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  29.52 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1002 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.66 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.07 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  32.58 
 
 		 1910 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  29.34 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  33.55 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.09 
 
 		 565 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  33.93 
 
 		 1105 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  28.4 
 
 		 746 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.16 
 
 		 2413 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  24.7 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>