More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0800 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0800  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5130  hypothetical protein  65.16 
 
 		 271 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0219324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58600  hypothetical protein  63.11 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  59.75 
 
 		 256 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12410  tetratricopeptide-like helical protein  60.64 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0893  Sel1 domain-containing protein  59.75 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.131651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4315  Sel1 domain-containing protein  59.75 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0906  Sel1 domain-containing protein  59.34 
 
 		 249 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0991  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.54 
 
 		 239 aa  211  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.659562  normal  0.202953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0793  hypothetical protein  45 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.303568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0893  TPR repeat-containing protein  50.47 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0664052  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4713  Sel1 domain-containing protein  50.47 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.767637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0199  hypothetical protein  49.33 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1689  TPR repeat-containing protein  49.33 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3794  Sel1 domain-containing protein  50 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4191  Sel1 domain-containing protein  49.53 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5474  Sel1 domain-containing protein  46.12 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal  0.0666513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3558  Sel1 repeat-containing protein  46.12 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4809  Sel1 domain-containing protein  46.12 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4024  Sel1 domain-containing protein  46.38 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  42.37 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  43.3 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1202  hypothetical protein  49.33 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1608  hypothetical protein  48.89 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.03 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0100  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.25 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.334736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.75 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1950  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.06 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.71 
 
 		 233 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.45 
 
 		 1402 aa  105  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.69 
 
 		 831 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  34.16 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  37.37 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  35.71 
 
 		 961 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.78 
 
 		 489 aa  99.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.26 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.41 
 
 		 392 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.5 
 
 		 684 aa  97.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 789 aa  95.9  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.83 
 
 		 528 aa  95.1  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 1032 aa  95.1  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.81 
 
 		 376 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.42 
 
 		 1493 aa  93.2  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.81 
 
 		 376 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  35.71 
 
 		 490 aa  92  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.71 
 
 		 490 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.81 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.61 
 
 		 318 aa  89  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.7 
 
 		 416 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  42.5 
 
 		 359 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  35.81 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.12 
 
 		 425 aa  87  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.59 
 
 		 557 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 		 448 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.16 
 
 		 685 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.06 
 
 		 316 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.54 
 
 		 321 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.67 
 
 		 341 aa  85.5  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.89 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  38.03 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1002 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.18 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.95 
 
 		 464 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 976 aa  82  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.55 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.04 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  32.04 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  30.73 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  30.15 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.1 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.15 
 
 		 2413 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.06 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  32.14 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.05 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  37.82 
 
 		 505 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.61 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29 
 
 		 1037 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  28.33 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  30.15 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.33 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 		 117 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.52 
 
 		 731 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  31.02 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  35.76 
 
 		 1910 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  36.02 
 
 		 839 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.43 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.02 
 
 		 838 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  24.58 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30 
 
 		 1877 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  31.5 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.85 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.06 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  32.75 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  35.03 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.21 
 
 		 971 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  35.21 
 
 		 971 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  34.03 
 
 		 591 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>