More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58600 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_58600  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5130  hypothetical protein  84.87 
 
 		 271 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0219324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0800  Sel1 repeat-containing protein  63.11 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  56.85 
 
 		 256 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12410  tetratricopeptide-like helical protein  57.66 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4315  Sel1 domain-containing protein  57.26 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0893  Sel1 domain-containing protein  57.26 
 
 		 249 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.131651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0906  Sel1 domain-containing protein  56.43 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  47.39 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  42.69 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0793  hypothetical protein  47.53 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.303568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0991  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.92 
 
 		 239 aa  181  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.659562  normal  0.202953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4024  Sel1 domain-containing protein  47.03 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3794  Sel1 domain-containing protein  47.32 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889747 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0199  hypothetical protein  47.56 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1689  TPR repeat-containing protein  47.56 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5474  Sel1 domain-containing protein  47.32 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal  0.0666513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3558  Sel1 repeat-containing protein  47.32 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4809  Sel1 domain-containing protein  47.32 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4713  Sel1 domain-containing protein  47.66 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.767637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4191  Sel1 domain-containing protein  47.2 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1608  hypothetical protein  47.11 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0893  TPR repeat-containing protein  46.82 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0664052  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1202  hypothetical protein  47.56 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.81 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0100  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.92 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.334736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1950  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.78 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.29 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.64 
 
 		 233 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.07 
 
 		 831 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.68 
 
 		 489 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.6 
 
 		 416 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.04 
 
 		 684 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.39 
 
 		 1402 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.47 
 
 		 557 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.09 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.56 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.46 
 
 		 305 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 393 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.05 
 
 		 685 aa  99.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.82 
 
 		 490 aa  99  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.6 
 
 		 490 aa  98.6  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.16 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.44 
 
 		 325 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  31.44 
 
 		 325 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1493 aa  95.5  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  32.16 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.78 
 
 		 528 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.73 
 
 		 376 aa  92.8  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.05 
 
 		 961 aa  92.4  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.9 
 
 		 359 aa  92.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.3 
 
 		 341 aa  92.4  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.41 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.25 
 
 		 376 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  31.88 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  34.06 
 
 		 358 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.8 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  36.09 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1037 aa  89  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.49 
 
 		 346 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 		 1032 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.46 
 
 		 425 aa  88.2  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38 
 
 		 392 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 		 448 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.8 
 
 		 789 aa  87  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32 
 
 		 343 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  33.33 
 
 		 232 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  31.44 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.69 
 
 		 245 aa  86.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  30.42 
 
 		 464 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.89 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30 
 
 		 1002 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.56 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.98 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  35.24 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  30.13 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  29.26 
 
 		 331 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  29.26 
 
 		 331 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 976 aa  82  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.35 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  29.52 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  35.15 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.16 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  28.97 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.84 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.7 
 
 		 2413 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.79 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 552 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  30.5 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  28.95 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 		 1430 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.23 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  35.03 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.31 
 
 		 523 aa  79  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  37.91 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.58 
 
 		 593 aa  78.2  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  35.47 
 
 		 839 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.03 
 
 		 971 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>