More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12410 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_12410  tetratricopeptide-like helical protein  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0800  Sel1 repeat-containing protein  60.64 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5130  hypothetical protein  59.27 
 
 		 271 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0219324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58600  hypothetical protein  57.66 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  56.33 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  49.14 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0906  Sel1 domain-containing protein  54.25 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0893  Sel1 domain-containing protein  53.85 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.131651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4315  Sel1 domain-containing protein  54 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  46.67 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1689  TPR repeat-containing protein  53.37 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0199  hypothetical protein  53.37 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1202  hypothetical protein  52.75 
 
 		 247 aa  184  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0991  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.659562  normal  0.202953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3794  Sel1 domain-containing protein  53.96 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4024  Sel1 domain-containing protein  47.86 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4713  Sel1 domain-containing protein  53.47 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.767637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4191  Sel1 domain-containing protein  53.26 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5474  Sel1 domain-containing protein  53.26 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal  0.0666513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3558  Sel1 repeat-containing protein  53.26 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4809  Sel1 domain-containing protein  53.26 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0893  TPR repeat-containing protein  52.48 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0664052  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1608  hypothetical protein  52.88 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0793  hypothetical protein  50.5 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.303568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.95 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0100  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50.26 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.334736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50.79 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.54 
 
 		 233 aa  148  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1950  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.29 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1402 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.75 
 
 		 305 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.19 
 
 		 392 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.35 
 
 		 961 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.26 
 
 		 831 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.81 
 
 		 318 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  40.48 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.5 
 
 		 684 aa  97.1  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  96.3  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.47 
 
 		 489 aa  95.5  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  42.5 
 
 		 359 aa  95.1  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.62 
 
 		 490 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.62 
 
 		 490 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36.21 
 
 		 393 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 685 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  35.26 
 
 		 557 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  41.51 
 
 		 358 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.11 
 
 		 341 aa  90.1  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1493 aa  90.5  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1002 aa  90.1  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.88 
 
 		 789 aa  89.7  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 		 325 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1037 aa  87.8  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.76 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 		 325 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.83 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  29.33 
 
 		 373 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  37.57 
 
 		 1032 aa  85.9  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.1 
 
 		 425 aa  85.1  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.92 
 
 		 2413 aa  85.1  9e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.46 
 
 		 416 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  32.79 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  35.12 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.89 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32 
 
 		 528 aa  82.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  32.79 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  29.94 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1877 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.18 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 976 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.66 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.14 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.77 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.4 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.4 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  33.54 
 
 		 850 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.74 
 
 		 512 aa  79.7  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.32 
 
 		 346 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.9 
 
 		 838 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  33.77 
 
 		 185 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  29.31 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  35.37 
 
 		 839 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  38.06 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  29.65 
 
 		 1200 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1281 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  35.14 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  29.65 
 
 		 1200 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  33.66 
 
 		 961 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.43 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.93 
 
 		 552 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.06 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.93 
 
 		 971 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  25.58 
 
 		 693 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  32.7 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  34.91 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  32.7 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  32.7 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  32.32 
 
 		 380 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>