19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1674 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1674  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  993    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  27.48 
 
 		 204 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1028  Sel1 domain-containing protein  32.69 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18520  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  27.83 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119912  normal  0.727737 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1134 aa  47  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1602  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  27.83 
 
 		 475 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  25.71 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0957  Sel1 repeat-containing protein  31.96 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.46 
 
 		 523 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1060  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.82 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4218  Sel1 domain-containing protein  26.83 
 
 		 220 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.000336684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  28.04 
 
 		 213 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0748  Sel1 domain-containing protein  25.53 
 
 		 218 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000706188  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0510  Sel1  26.77 
 
 		 205 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1240  alginate biosynthesis protein AlgK  32.22 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.3 
 
 		 380 aa  44.3  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10940  Alginate biosynthetic protein AlgK  33.33 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.665621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  32.04 
 
 		 410 aa  43.5  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>