85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10940 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_10940  Alginate biosynthetic protein AlgK  100 
 
 		 457 aa  922    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.665621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1240  alginate biosynthesis protein AlgK  57.21 
 
 		 470 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0957  Sel1 repeat-containing protein  56.26 
 
 		 468 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1060  Sel1 repeat-containing protein  56.55 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18520  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  59.68 
 
 		 475 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119912  normal  0.727737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1028  Sel1 domain-containing protein  57.99 
 
 		 458 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1602  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  59.22 
 
 		 475 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4440  Sel1 domain-containing protein  56.42 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736326  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1285  Sel1 domain protein repeat-containing protein  55.97 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000475097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4564  Sel1 domain-containing protein  56.5 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0886  Sel1 domain-containing protein  56.68 
 
 		 475 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  34.56 
 
 		 789 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.5 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  38.6 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2985  Sel1 domain-containing protein  29.91 
 
 		 504 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.66 
 
 		 865 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.4 
 
 		 1402 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  24.01 
 
 		 684 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  27.39 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.47 
 
 		 380 aa  57  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.58 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.56 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  32.58 
 
 		 365 aa  54.7  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  23.97 
 
 		 961 aa  53.5  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  29.1 
 
 		 254 aa  53.5  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  31.41 
 
 		 276 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.11 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.13 
 
 		 270 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4032  beta strand repeat-containing protein  32.69 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.488717 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  27.27 
 
 		 838 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  29.2 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  32.16 
 
 		 269 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1037 aa  50.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.54 
 
 		 232 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.53 
 
 		 290 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.08 
 
 		 890 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  28.85 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  31.09 
 
 		 117 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  26.35 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.84 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  28.66 
 
 		 234 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.58 
 
 		 373 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  23.21 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.58 
 
 		 255 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.21 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.24 
 
 		 255 aa  47.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.06 
 
 		 347 aa  47.4  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  32.46 
 
 		 817 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.82 
 
 		 346 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2923  Sel1 domain-containing protein  30.61 
 
 		 300 aa  47  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1032 aa  47  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.16 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  26.26 
 
 		 971 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2849  Sel1 domain-containing protein  34.67 
 
 		 89 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0412947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.45 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  31.16 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  31.78 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.08 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.16 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  23.04 
 
 		 831 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.26 
 
 		 971 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  32.61 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  29.32 
 
 		 246 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1161  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 305 aa  44.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000511237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 303 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1002 aa  44.3  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.17 
 
 		 528 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1674  hypothetical protein  33.33 
 
 		 491 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1493 aa  44.3  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5130  hypothetical protein  33.04 
 
 		 271 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0219324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  27.91 
 
 		 305 aa  43.9  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4706  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0626752  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0573  Sel1  30.71 
 
 		 267 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.03 
 
 		 222 aa  43.5  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  31.08 
 
 		 985 aa  43.5  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0220  Sel1 repeat-containing protein  30.08 
 
 		 276 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.48 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  32.17 
 
 		 368 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  28.46 
 
 		 219 aa  43.1  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>