287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1161 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1161  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 305 aa  630  1e-180  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000511237  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.76 
 
 		 684 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.8 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.16 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.07 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.21 
 
 		 1402 aa  72  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.41 
 
 		 865 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.79 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.78 
 
 		 831 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  34.85 
 
 		 789 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.38 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.13 
 
 		 490 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.85 
 
 		 961 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.35 
 
 		 373 aa  68.9  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 1032 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.06 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  32.33 
 
 		 971 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.56 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.76 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  27.84 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.45 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1493 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.33 
 
 		 971 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.79 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.97 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  33.08 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  34.4 
 
 		 838 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  32.41 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.25 
 
 		 1012 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  26.19 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  33.86 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.45 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  33.08 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1950  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.52 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  33.08 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  29.37 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  32.81 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 976 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  32.54 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  30.94 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.66 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1002 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  31.82 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1037 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.78 
 
 		 2413 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  31.82 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.15 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  31.25 
 
 		 985 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  28.14 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  30.83 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.58 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.15 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  37.11 
 
 		 679 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  30.65 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  25.91 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.59 
 
 		 850 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.58 
 
 		 798 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.16 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.56 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.79 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.54 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.11 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  33.33 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0991  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.22 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.659562  normal  0.202953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  28.23 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.48 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.78 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  33.33 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.8 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  29.37 
 
 		 1200 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  29.37 
 
 		 1200 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  30.19 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  31.87 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58600  hypothetical protein  32.52 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.46 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  28.46 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  29.58 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  24.43 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.17 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.61 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  28.17 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.52 
 
 		 523 aa  55.8  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  24.43 
 
 		 509 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  24.43 
 
 		 509 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  28.79 
 
 		 1044 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.27 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  28.79 
 
 		 1078 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  24.43 
 
 		 509 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  28.21 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.56 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 		 1430 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81785  chitin synthase regulatory factor  34.4 
 
 		 613 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.757769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.75 
 
 		 685 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.93 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.5 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1110 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  30.58 
 
 		 693 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>