50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1602 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1602  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  100 
 
 		 475 aa  937    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18520  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  98.53 
 
 		 475 aa  923    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119912  normal  0.727737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1240  alginate biosynthesis protein AlgK  59.91 
 
 		 470 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1060  Sel1 repeat-containing protein  59.91 
 
 		 470 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0957  Sel1 repeat-containing protein  58.19 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10940  Alginate biosynthetic protein AlgK  58.88 
 
 		 457 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.665621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1028  Sel1 domain-containing protein  58.9 
 
 		 458 aa  501  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4440  Sel1 domain-containing protein  59.46 
 
 		 477 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736326  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4564  Sel1 domain-containing protein  59.46 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1285  Sel1 domain protein repeat-containing protein  59.01 
 
 		 484 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000475097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0886  Sel1 domain-containing protein  57.99 
 
 		 475 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.67 
 
 		 254 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  28.28 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  33.11 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.18 
 
 		 382 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  28.57 
 
 		 254 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.82 
 
 		 321 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  32.82 
 
 		 365 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 528 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2814  Sel1 domain-containing protein  36.78 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499703  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2985  Sel1 domain-containing protein  28.86 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  27.66 
 
 		 241 aa  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  26.57 
 
 		 278 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2952  Sel1 domain-containing protein  35.63 
 
 		 285 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2912  Sel1 domain-containing protein  33.77 
 
 		 281 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.38 
 
 		 380 aa  47  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.29 
 
 		 450 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1402 aa  47  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1674  hypothetical protein  27.83 
 
 		 491 aa  47  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2288  Sel1 repeat-containing protein  33.77 
 
 		 285 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.208502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2903  Sel1 domain-containing protein  33.77 
 
 		 285 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  29.5 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.72 
 
 		 971 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  30.15 
 
 		 523 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.39 
 
 		 789 aa  46.6  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1366 aa  46.6  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.46 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.78 
 
 		 684 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.32 
 
 		 865 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  24.64 
 
 		 971 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.38 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 		 705 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  30.08 
 
 		 348 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  30.28 
 
 		 366 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 997 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.54 
 
 		 347 aa  43.9  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  32.5 
 
 		 322 aa  43.9  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.43 
 
 		 208 aa  43.5  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  26.62 
 
 		 202 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>