121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0886 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1285  Sel1 domain protein repeat-containing protein  93.86 
 
 		 484 aa  846    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000475097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1240  alginate biosynthesis protein AlgK  67.65 
 
 		 470 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0957  Sel1 repeat-containing protein  71.15 
 
 		 468 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4440  Sel1 domain-containing protein  92.8 
 
 		 477 aa  840    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736326  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4564  Sel1 domain-containing protein  93.74 
 
 		 516 aa  832    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0886  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 475 aa  949    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1060  Sel1 repeat-containing protein  67.44 
 
 		 470 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18520  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  58.64 
 
 		 475 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119912  normal  0.727737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1602  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  57.99 
 
 		 475 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10940  Alginate biosynthetic protein AlgK  56.03 
 
 		 457 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.665621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1028  Sel1 domain-containing protein  56.82 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2985  Sel1 domain-containing protein  30.87 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.45 
 
 		 254 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  25.79 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  28.99 
 
 		 359 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  25.82 
 
 		 393 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.71 
 
 		 684 aa  55.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1402 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.63 
 
 		 267 aa  53.9  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  31.45 
 
 		 213 aa  53.5  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  29.91 
 
 		 789 aa  53.9  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.5 
 
 		 218 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.96 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.96 
 
 		 255 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  27.14 
 
 		 254 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.25 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  32.08 
 
 		 235 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0573  Sel1  40 
 
 		 267 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.25 
 
 		 208 aa  50.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  37.63 
 
 		 368 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.44 
 
 		 318 aa  50.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.59 
 
 		 272 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0510  Sel1  33.64 
 
 		 205 aa  50.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  24.52 
 
 		 680 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  26.24 
 
 		 278 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1037 aa  50.1  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  24.48 
 
 		 373 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4315  Sel1 domain-containing protein  34.48 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  32.95 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.34 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.34 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.02 
 
 		 232 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0696  Sel1 domain-containing protein  34.44 
 
 		 218 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105771  hitchhiker  0.000122446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  31.13 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0906  Sel1 domain-containing protein  32.98 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 997 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.13 
 
 		 321 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.19 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3265  Sel1 domain-containing protein  34.44 
 
 		 218 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000032376  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0682  Sel1 domain-containing protein  34.44 
 
 		 218 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.97 
 
 		 865 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 976 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  29.06 
 
 		 831 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  26.15 
 
 		 817 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.48 
 
 		 685 aa  47.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.22 
 
 		 328 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1493 aa  47.4  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.94 
 
 		 890 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  30.65 
 
 		 267 aa  47  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0893  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.131651 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  32.32 
 
 		 722 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2814  Sel1 domain-containing protein  36.99 
 
 		 285 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499703  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  32.32 
 
 		 722 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  32.17 
 
 		 367 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  24.48 
 
 		 961 aa  47  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  32.32 
 
 		 722 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  32.32 
 
 		 722 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3936  sodium-type flagellar protein MotX  33.02 
 
 		 206 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  28.44 
 
 		 485 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1134  Sel1 domain-containing protein  29.2 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  34.06 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.97 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  29.82 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  36.05 
 
 		 1105 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.15 
 
 		 223 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2952  Sel1 domain-containing protein  35.62 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3451  hypothetical protein  36.36 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  26.11 
 
 		 1078 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0479  tetratricopeptide repeat protein  32.46 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  26.11 
 
 		 1044 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.93 
 
 		 347 aa  45.8  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0477  tetratricopeptide repeat protein  32.46 
 
 		 496 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.486757  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.63 
 
 		 838 aa  45.8  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0485  tetratricopeptide repeat protein  32.46 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0540  tetratricopeptide repeat protein  32.46 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.96 
 
 		 347 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.13 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  25 
 
 		 331 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.12 
 
 		 860 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.62 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  31.25 
 
 		 185 aa  45.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  29.75 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3648  Sel1 domain-containing protein  28.47 
 
 		 218 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1674  hypothetical protein  31.03 
 
 		 491 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0736  Sel1 domain-containing protein  28.47 
 
 		 218 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00305878  hitchhiker  0.000755145 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>