169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3936 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3936  sodium-type flagellar protein MotX  100 
 
 		 206 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3265  Sel1 domain-containing protein  95.63 
 
 		 218 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000032376  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0682  Sel1 domain-containing protein  95.63 
 
 		 218 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0696  Sel1 domain-containing protein  95.63 
 
 		 218 aa  408  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105771  hitchhiker  0.000122446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0748  Sel1 domain-containing protein  88.83 
 
 		 218 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000706188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0736  Sel1 domain-containing protein  87.86 
 
 		 218 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00305878  hitchhiker  0.000755145 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3648  Sel1 domain-containing protein  87.86 
 
 		 218 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0727  Sel1 domain protein repeat-containing protein  87.86 
 
 		 218 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159211  hitchhiker  0.00000977989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0706  Sel1 domain-containing protein  87.38 
 
 		 218 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00465752  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0751  Sel1 domain-containing protein  68.29 
 
 		 227 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000018908  hitchhiker  0.00284234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3290  Sel1 domain-containing protein  74.47 
 
 		 228 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000129217  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3591  Sel1 domain-containing protein  65.05 
 
 		 207 aa  296  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000355002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  69.23 
 
 		 213 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4218  Sel1 domain-containing protein  67.16 
 
 		 220 aa  284  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.000336684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0510  Sel1  70.9 
 
 		 205 aa  276  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  64.04 
 
 		 204 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0993  Sel1 repeat-containing protein  47.09 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03473  sodium-type flagellar motor component  46.86 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4618  sodium-type flagellar protein MotX  42.72 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2179  sodium-type flagellar protein MotX  43.58 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000273255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00088  sodium-type polar flagellar protein MotX  40.69 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  40.69 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2771  sodium-type polar flagellar protein MotX  41.11 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.33 
 
 		 685 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  33.59 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  33.04 
 
 		 679 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  35.48 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  35.05 
 
 		 680 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.41 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.31 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.63 
 
 		 831 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  34.69 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  34.69 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  32.43 
 
 		 961 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.44 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  33.67 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  33.67 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  31.25 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  33.67 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  33.67 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  33.67 
 
 		 415 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 1032 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  32.65 
 
 		 258 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  33.67 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  32.65 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1037 aa  52  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  31.93 
 
 		 260 aa  52  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  32.65 
 
 		 260 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  31.06 
 
 		 246 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.83 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  32.65 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  30.94 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  30.43 
 
 		 489 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.29 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  29.93 
 
 		 358 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  32.65 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  32.65 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  32.65 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.43 
 
 		 393 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.25 
 
 		 789 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.43 
 
 		 971 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.25 
 
 		 272 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.43 
 
 		 971 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  31.25 
 
 		 509 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  31.25 
 
 		 509 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1493 aa  50.1  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  28.68 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.42 
 
 		 325 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.52 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  25.42 
 
 		 325 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.43 
 
 		 528 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.18 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  28.78 
 
 		 255 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2610  hypothetical protein  34.52 
 
 		 175 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.29 
 
 		 684 aa  48.5  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.53 
 
 		 2413 aa  48.5  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.85 
 
 		 890 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  29.13 
 
 		 403 aa  48.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  31.25 
 
 		 509 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.75 
 
 		 380 aa  48.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0496  tetratricopeptide repeat family protein  35.85 
 
 		 615 aa  48.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  31.25 
 
 		 509 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.52 
 
 		 376 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.09 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  31.68 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  27.64 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.6 
 
 		 961 aa  47.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.29 
 
 		 264 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 1430 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  31.52 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  32.71 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.52 
 
 		 376 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  32.26 
 
 		 342 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  27.87 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  32.69 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 448 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1276  hypothetical protein  29.17 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.83 
 
 		 416 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>