129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0510 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0510  Sel1  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3936  sodium-type flagellar protein MotX  68.93 
 
 		 206 aa  285  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  70.16 
 
 		 213 aa  283  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3265  Sel1 domain-containing protein  67.48 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000032376  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0682  Sel1 domain-containing protein  67.48 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0696  Sel1 domain-containing protein  67.48 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105771  hitchhiker  0.000122446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0748  Sel1 domain-containing protein  65.53 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000706188  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3648  Sel1 domain-containing protein  65.53 
 
 		 218 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0736  Sel1 domain-containing protein  65.53 
 
 		 218 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00305878  hitchhiker  0.000755145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0727  Sel1 domain protein repeat-containing protein  65.53 
 
 		 218 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159211  hitchhiker  0.00000977989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3290  Sel1 domain-containing protein  68.09 
 
 		 228 aa  275  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000129217  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0706  Sel1 domain-containing protein  65.05 
 
 		 218 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00465752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3591  Sel1 domain-containing protein  59.71 
 
 		 207 aa  263  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000355002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0751  Sel1 domain-containing protein  59.51 
 
 		 227 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000018908  hitchhiker  0.00284234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4218  Sel1 domain-containing protein  60.1 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.000336684 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  56.57 
 
 		 204 aa  227  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0993  Sel1 repeat-containing protein  47.31 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4618  sodium-type flagellar protein MotX  42.86 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03473  sodium-type flagellar motor component  46.81 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2179  sodium-type flagellar protein MotX  43.5 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000273255  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  41.92 
 
 		 211 aa  144  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00088  sodium-type polar flagellar protein MotX  41.12 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2771  sodium-type polar flagellar protein MotX  39.33 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.15 
 
 		 685 aa  65.5  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.13 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  32.43 
 
 		 831 aa  55.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.48 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.82 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.62 
 
 		 373 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.36 
 
 		 393 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  33.05 
 
 		 680 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 976 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  37.08 
 
 		 684 aa  52.8  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.71 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.19 
 
 		 789 aa  52  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  31.82 
 
 		 1044 aa  51.2  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  39.76 
 
 		 1430 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  31.82 
 
 		 1078 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.56 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0886  Sel1 domain-containing protein  33.64 
 
 		 475 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.18 
 
 		 961 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1285  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.64 
 
 		 484 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000475097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  29.21 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4440  Sel1 domain-containing protein  33.64 
 
 		 477 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736326  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1002 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1402 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.96 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4564  Sel1 domain-containing protein  32.71 
 
 		 516 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  34.44 
 
 		 271 aa  48.9  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.66 
 
 		 2413 aa  48.9  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  34.41 
 
 		 305 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34 
 
 		 382 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  31.96 
 
 		 679 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.44 
 
 		 557 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.08 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  25.19 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.76 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 		 448 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.98 
 
 		 318 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.72 
 
 		 489 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.77 
 
 		 264 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  31.58 
 
 		 365 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  29.55 
 
 		 720 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  29.55 
 
 		 720 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  29.55 
 
 		 720 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.83 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4948  Sel1 repeat-containing protein  32.93 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  32.17 
 
 		 961 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 1032 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1037 aa  46.2  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.58 
 
 		 331 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  28.1 
 
 		 254 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3423  Sel1 domain-containing protein  51.02 
 
 		 502 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.59 
 
 		 838 aa  45.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.15 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  30.7 
 
 		 117 aa  45.4  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  32.95 
 
 		 478 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  37.08 
 
 		 1910 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 425 aa  45.1  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 865 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1674  hypothetical protein  26.77 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  34.12 
 
 		 410 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  33.73 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  31.48 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  27.83 
 
 		 416 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  31.46 
 
 		 372 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.81 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 		 360 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.46 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  29.35 
 
 		 765 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.14 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  28.8 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  32.26 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  23.14 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>