287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3827 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4276  Sel1 domain-containing protein  76.48 
 
 		 491 aa  766    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4559  hypothetical protein  90.91 
 
 		 484 aa  876    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4143  Sel1 domain-containing protein  77.35 
 
 		 491 aa  766    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0321  Sel1 domain-containing protein  77.89 
 
 		 484 aa  774    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.845826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0192  Sel1 domain protein repeat-containing protein  76.69 
 
 		 491 aa  760    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3754  Sel1 domain-containing protein  98.56 
 
 		 485 aa  976    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 485 aa  990    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0191  Sel1 domain-containing protein  76.73 
 
 		 491 aa  762    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3952  Sel1 domain-containing protein  97.53 
 
 		 485 aa  954    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3592  Sel1 domain-containing protein  63.6 
 
 		 472 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0572167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0250  Sel1 domain-containing protein  63.88 
 
 		 472 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3960  Sel1 domain-containing protein  61.09 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0249  Sel1 domain-containing protein  62.13 
 
 		 471 aa  571  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0389446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0289  Sel1 domain-containing protein  54.89 
 
 		 502 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3451  hypothetical protein  49.58 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.86 
 
 		 267 aa  82.8  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  23.15 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  29.44 
 
 		 831 aa  80.1  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  36 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 1032 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  28.4 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  28.02 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.72 
 
 		 865 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.58 
 
 		 961 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.52 
 
 		 684 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1402 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  31.82 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  38.66 
 
 		 490 aa  67  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.05 
 
 		 557 aa  67  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 		 997 aa  66.6  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.18 
 
 		 235 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  36.29 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  29.75 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.44 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  27.62 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  37.82 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.63 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  30.61 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.52 
 
 		 789 aa  63.5  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.27 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  25.07 
 
 		 373 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1493 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1877 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.93 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  30.88 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.72 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.26 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 976 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.24 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  34.75 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  34.75 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.27 
 
 		 860 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  34.75 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  34.75 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.9 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.26 
 
 		 731 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.74 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01554  activator of chitin synthase (Eurofung)  33.53 
 
 		 702 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.158425  normal  0.055064 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  30.52 
 
 		 536 aa  60.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.86 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  31.07 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  35.77 
 
 		 1086 aa  60.5  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.72 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.74 
 
 		 2413 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.83 
 
 		 859 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  34.13 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  32.73 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  26.86 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.05 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.65 
 
 		 838 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.54 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  26.03 
 
 		 685 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.16 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  32.31 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  32.77 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.11 
 
 		 1263 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.88 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  34.15 
 
 		 1059 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0465  hypothetical protein  36.61 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  32.64 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  29.89 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1002 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0500  hypothetical protein  33.9 
 
 		 331 aa  57  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  34.21 
 
 		 359 aa  57  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.61 
 
 		 382 aa  57  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0460  hypothetical protein  33.9 
 
 		 331 aa  57  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  29.45 
 
 		 246 aa  57  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00376  hypothetical protein  34.82 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0626977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00380  hypothetical protein  34.82 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  33.09 
 
 		 1105 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.12 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  29.22 
 
 		 221 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1037 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  28.88 
 
 		 839 aa  56.6  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  35.66 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  29.37 
 
 		 817 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  27.47 
 
 		 245 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>