220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0250 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3960  Sel1 domain-containing protein  68.42 
 
 		 473 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0250  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 472 aa  969    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0249  Sel1 domain-containing protein  76.06 
 
 		 471 aa  696    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0389446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3592  Sel1 domain-containing protein  68.43 
 
 		 472 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0572167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4143  Sel1 domain-containing protein  63.43 
 
 		 491 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0321  Sel1 domain-containing protein  64.72 
 
 		 484 aa  618  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.845826  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4276  Sel1 domain-containing protein  63.43 
 
 		 491 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0191  Sel1 domain-containing protein  63.22 
 
 		 491 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  63.88 
 
 		 485 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0192  Sel1 domain protein repeat-containing protein  63.22 
 
 		 491 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4559  hypothetical protein  64.51 
 
 		 484 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3952  Sel1 domain-containing protein  64.09 
 
 		 485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3754  Sel1 domain-containing protein  64.3 
 
 		 485 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0289  Sel1 domain-containing protein  52.59 
 
 		 502 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3451  hypothetical protein  49.57 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  25.75 
 
 		 544 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.39 
 
 		 865 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.54 
 
 		 684 aa  70.1  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.45 
 
 		 2413 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.34 
 
 		 1402 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.74 
 
 		 838 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  28.45 
 
 		 961 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.75 
 
 		 831 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.21 
 
 		 552 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  31.43 
 
 		 1059 aa  63.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.09 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.12 
 
 		 271 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.52 
 
 		 343 aa  63.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  26.67 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  33.53 
 
 		 839 aa  61.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.47 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1877 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.74 
 
 		 860 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.03 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  27.66 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  30.26 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1032 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  28.38 
 
 		 817 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.96 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  28.63 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.76 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.17 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.96 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.07 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  30.67 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 976 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2296  Sel1 domain-containing protein  31.03 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.21 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 		 859 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.94 
 
 		 1261 aa  57.4  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.03 
 
 		 341 aa  57  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  26.62 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  27.88 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 		 599 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.94 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  33.33 
 
 		 315 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  27.81 
 
 		 647 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.69 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  28.21 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.38 
 
 		 363 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  30.1 
 
 		 172 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.97 
 
 		 593 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  27.84 
 
 		 685 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1110 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  30.19 
 
 		 184 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  31.22 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  30.19 
 
 		 184 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  30.19 
 
 		 184 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  30.19 
 
 		 184 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.93 
 
 		 254 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  29.38 
 
 		 720 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 		 358 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1037 aa  54.3  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  32.08 
 
 		 348 aa  54.3  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  31.08 
 
 		 1086 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  29.38 
 
 		 720 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 294 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.79 
 
 		 1263 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  29.38 
 
 		 720 aa  53.9  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  28.43 
 
 		 789 aa  53.9  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.4 
 
 		 347 aa  53.9  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  26.46 
 
 		 267 aa  53.5  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.26 
 
 		 565 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.63 
 
 		 321 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0215  hypothetical protein  26.11 
 
 		 385 aa  53.9  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.613438  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.21 
 
 		 528 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.25 
 
 		 184 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  36.52 
 
 		 228 aa  53.1  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  27.13 
 
 		 350 aa  53.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  27.67 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  27.67 
 
 		 362 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1366 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  35.96 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1160 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  34.75 
 
 		 586 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  31.97 
 
 		 1134 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>